25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_0491 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013037  Dfer_0491  hypothetical protein  100 
 
 
130 aa  261  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.242929  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2827  hypothetical protein  72.13 
 
 
124 aa  179  1e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000159282  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4831  hypothetical protein  70.73 
 
 
131 aa  179  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000177974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2123  hypothetical protein  66.39 
 
 
124 aa  176  7e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.815459  normal  0.606947 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2914  hypothetical protein  69.42 
 
 
127 aa  171  3.9999999999999995e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5772  hypothetical protein  40.32 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.962676  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3575  hypothetical protein  42.61 
 
 
125 aa  92.4  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.426744  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3402  hypothetical protein  40.87 
 
 
189 aa  85.1  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1267  hypothetical protein  45.45 
 
 
121 aa  82.8  0.000000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3625  hypothetical protein  33.91 
 
 
122 aa  68.2  0.00000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4305  hypothetical protein  41.38 
 
 
126 aa  63.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1691  hypothetical protein  41.94 
 
 
120 aa  61.2  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1837  hypothetical protein  35.09 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210013  hitchhiker  0.000000193845 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3835  hypothetical protein  34.02 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02425  hypothetical protein  31.03 
 
 
117 aa  57.4  0.00000007  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3265  hypothetical protein  31.58 
 
 
127 aa  57.4  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.240079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0582  hypothetical protein  32.17 
 
 
128 aa  54.7  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0815  hypothetical protein  36.84 
 
 
129 aa  52.4  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0259852  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3998  hypothetical protein  36.84 
 
 
133 aa  50.8  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0382  hypothetical protein  41.38 
 
 
149 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0579  hypothetical protein  31.51 
 
 
165 aa  45.4  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5894  DoxX family protein  33.96 
 
 
132 aa  43.9  0.0007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.900026  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3326  hypothetical protein  30.09 
 
 
135 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.333585  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4117  DoxX family protein  30.43 
 
 
98 aa  43.5  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1073  hypothetical protein  30.69 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>