18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02425 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_02425  hypothetical protein  100 
 
 
117 aa  235  1e-61  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3625  hypothetical protein  37.04 
 
 
122 aa  64.7  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2123  hypothetical protein  31.36 
 
 
124 aa  61.6  0.000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.815459  normal  0.606947 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4831  hypothetical protein  38.54 
 
 
131 aa  60.8  0.000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000177974 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1691  hypothetical protein  37.04 
 
 
120 aa  58.9  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5772  hypothetical protein  30.48 
 
 
133 aa  57.4  0.00000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.962676  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2827  hypothetical protein  31.36 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000159282  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1267  hypothetical protein  33.33 
 
 
121 aa  55.1  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.59263 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3835  hypothetical protein  34.74 
 
 
137 aa  54.7  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3326  hypothetical protein  30.97 
 
 
135 aa  53.5  0.0000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.333585  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0491  hypothetical protein  32.26 
 
 
130 aa  52.8  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.242929  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2914  hypothetical protein  28.81 
 
 
127 aa  52.4  0.000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.343136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0815  hypothetical protein  33.71 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0259852  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0582  hypothetical protein  30.68 
 
 
128 aa  47.4  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1837  hypothetical protein  30.43 
 
 
123 aa  45.1  0.0003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.210013  hitchhiker  0.000000193845 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3998  hypothetical protein  33.71 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4305  hypothetical protein  33.75 
 
 
126 aa  41.6  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3265  hypothetical protein  27.93 
 
 
127 aa  41.2  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.240079 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>