29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_4521 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_4521  hypothetical protein  100 
 
 		 323 aa  664    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3832  hypothetical protein  33.79 
 
 		 326 aa  90.5  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3734  hypothetical protein  22.68 
 
 		 298 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0573  hypothetical protein  25.82 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3917  hypothetical protein  24.05 
 
 		 298 aa  70.9  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0534  hypothetical protein  24.05 
 
 		 298 aa  70.5  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0574  hypothetical protein  25.46 
 
 		 337 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0573  hypothetical protein  24.68 
 
 		 319 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3791  hypothetical protein  24.05 
 
 		 300 aa  70.1  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3303  hypothetical protein  23.11 
 
 		 294 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3456  hypothetical protein  25 
 
 		 337 aa  67  0.0000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0456  hypothetical protein  23.18 
 
 		 294 aa  64.7  0.000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3509  hypothetical protein  23.02 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3133  hypothetical protein  22.39 
 
 		 303 aa  62  0.00000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0745  hypothetical protein  22.19 
 
 		 321 aa  58.2  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4325  hypothetical protein  23.27 
 
 		 297 aa  52  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.946347  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0535  hypothetical protein  23.39 
 
 		 292 aa  52.4  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0624  hypothetical protein  21.01 
 
 		 293 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5128  hypothetical protein  31.25 
 
 		 329 aa  49.7  0.00007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.933275  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3705  hypothetical protein  19.59 
 
 		 312 aa  49.3  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07810  hypothetical protein  31.63 
 
 		 353 aa  48.5  0.0001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4006  hypothetical protein  29.69 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0439  hypothetical protein  25.62 
 
 		 332 aa  46.2  0.0007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0743  hypothetical protein  35.9 
 
 		 349 aa  46.2  0.0008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00643704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1056  hypothetical protein  24.51 
 
 		 332 aa  45.8  0.0009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000661942  normal  0.66241 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4794  hypothetical protein  29.11 
 
 		 331 aa  45.4  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03701  hypothetical protein  23.42 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0408  hypothetical protein  20.34 
 
 		 332 aa  42.7  0.007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4620  hypothetical protein  30.43 
 
 		 334 aa  42.4  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  0.677055 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>