18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4325 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4325  hypothetical protein  100 
 
 
297 aa  613  1e-175  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.946347  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0624  hypothetical protein  67.47 
 
 
293 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0456  hypothetical protein  45.93 
 
 
294 aa  253  2.0000000000000002e-66  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0574  hypothetical protein  46.09 
 
 
337 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0573  hypothetical protein  45.88 
 
 
319 aa  233  3e-60  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3734  hypothetical protein  42.09 
 
 
298 aa  232  5e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3456  hypothetical protein  45.49 
 
 
337 aa  232  6e-60  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0573  hypothetical protein  43.54 
 
 
298 aa  231  9e-60  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0534  hypothetical protein  41.75 
 
 
298 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3791  hypothetical protein  41.47 
 
 
300 aa  229  3e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3917  hypothetical protein  45.28 
 
 
298 aa  229  4e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3303  hypothetical protein  43.88 
 
 
294 aa  226  4e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3705  hypothetical protein  39.61 
 
 
312 aa  206  6e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3133  hypothetical protein  38.7 
 
 
303 aa  186  4e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0535  hypothetical protein  35.14 
 
 
292 aa  174  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3509  hypothetical protein  34.77 
 
 
318 aa  169  4e-41  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3832  hypothetical protein  25.31 
 
 
326 aa  63.9  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4521  hypothetical protein  23.27 
 
 
323 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>