18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0624 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0624  hypothetical protein  100 
 
 		 293 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4325  hypothetical protein  67.47 
 
 		 297 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.946347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0456  hypothetical protein  51.55 
 
 		 294 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0574  hypothetical protein  47.84 
 
 		 337 aa  241  1e-62  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3456  hypothetical protein  47.24 
 
 		 337 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0573  hypothetical protein  46.88 
 
 		 298 aa  239  5e-62  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0573  hypothetical protein  45.82 
 
 		 319 aa  238  6.999999999999999e-62  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3734  hypothetical protein  43.29 
 
 		 298 aa  231  1e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3791  hypothetical protein  46.46 
 
 		 300 aa  229  5e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0534  hypothetical protein  46.46 
 
 		 298 aa  228  7e-59  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3917  hypothetical protein  42.95 
 
 		 298 aa  227  2e-58  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3303  hypothetical protein  42.41 
 
 		 294 aa  226  3e-58  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3705  hypothetical protein  43.73 
 
 		 312 aa  226  3e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3133  hypothetical protein  44.14 
 
 		 303 aa  210  2e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0535  hypothetical protein  36.65 
 
 		 292 aa  177  2e-43  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3509  hypothetical protein  32.76 
 
 		 318 aa  162  7e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3832  hypothetical protein  28.57 
 
 		 326 aa  69.3  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4521  hypothetical protein  21.01 
 
 		 323 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>