19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr7_3456 on replicon NC_008322
Organism: Shewanella sp. MR-7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008322  Shewmr7_3456  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  673    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0574  hypothetical protein  96.14 
 
 		 337 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0573  hypothetical protein  91.1 
 
 		 319 aa  576  1.0000000000000001e-163  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0573  hypothetical protein  80.98 
 
 		 298 aa  508  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3734  hypothetical protein  69.05 
 
 		 298 aa  446  1.0000000000000001e-124  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0534  hypothetical protein  83.01 
 
 		 298 aa  441  1e-123  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3791  hypothetical protein  82.44 
 
 		 300 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3917  hypothetical protein  82.44 
 
 		 298 aa  442  1e-123  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3303  hypothetical protein  80.43 
 
 		 294 aa  436  1e-121  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0624  hypothetical protein  47.24 
 
 		 293 aa  239  4e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4325  hypothetical protein  45.49 
 
 		 297 aa  232  7.000000000000001e-60  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.946347  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3133  hypothetical protein  45.49 
 
 		 303 aa  223  3e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0456  hypothetical protein  43.73 
 
 		 294 aa  215  7e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0535  hypothetical protein  41.85 
 
 		 292 aa  209  6e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3705  hypothetical protein  42.96 
 
 		 312 aa  202  7e-51  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3509  hypothetical protein  42.44 
 
 		 318 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3832  hypothetical protein  28.18 
 
 		 326 aa  73.6  0.000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4521  hypothetical protein  25 
 
 		 323 aa  67  0.0000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03701  hypothetical protein  26.95 
 
 		 276 aa  44.7  0.002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>