25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spea_3705 on replicon NC_009901
Organism: Shewanella pealeana ATCC 700345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009901  Spea_3705  hypothetical protein  100 
 
 
312 aa  625  1e-178  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0624  hypothetical protein  43.73 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0456  hypothetical protein  44.4 
 
 
294 aa  221  9.999999999999999e-57  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0574  hypothetical protein  45.35 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0573  hypothetical protein  45.15 
 
 
319 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4325  hypothetical protein  38.96 
 
 
297 aa  211  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.946347  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0573  hypothetical protein  42.38 
 
 
298 aa  209  5e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3456  hypothetical protein  43.96 
 
 
337 aa  207  2e-52  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3734  hypothetical protein  43.07 
 
 
298 aa  204  1e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3791  hypothetical protein  42.34 
 
 
300 aa  204  2e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3303  hypothetical protein  38.61 
 
 
294 aa  203  3e-51  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0534  hypothetical protein  43.07 
 
 
298 aa  203  3e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3917  hypothetical protein  41.97 
 
 
298 aa  202  5e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0535  hypothetical protein  34.69 
 
 
292 aa  155  9e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3133  hypothetical protein  36.82 
 
 
303 aa  152  8.999999999999999e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3509  hypothetical protein  33.96 
 
 
318 aa  135  7.000000000000001e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3832  hypothetical protein  27.42 
 
 
326 aa  72.8  0.000000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0442  hypothetical protein  30.08 
 
 
332 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.468578  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0408  hypothetical protein  30.08 
 
 
332 aa  55.1  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4794  hypothetical protein  41.33 
 
 
331 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142133  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0439  hypothetical protein  31.09 
 
 
332 aa  53.1  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4521  hypothetical protein  20.97 
 
 
323 aa  52  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4620  hypothetical protein  35.11 
 
 
334 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  0.677055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0558  hypothetical protein  36.23 
 
 
332 aa  45.4  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5128  hypothetical protein  37.14 
 
 
329 aa  45.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.933275  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>