15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_4620 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_4620  hypothetical protein  100 
 
 		 334 aa  658    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  0.677055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0558  hypothetical protein  81.14 
 
 		 332 aa  439  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0442  hypothetical protein  53.17 
 
 		 332 aa  300  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.468578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0439  hypothetical protein  52.57 
 
 		 332 aa  298  8e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0408  hypothetical protein  52.87 
 
 		 332 aa  295  1e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5128  hypothetical protein  49.4 
 
 		 329 aa  290  2e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.933275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4794  hypothetical protein  50.6 
 
 		 331 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07810  hypothetical protein  46 
 
 		 353 aa  250  3e-65  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0743  hypothetical protein  43.19 
 
 		 349 aa  243  3e-63  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00643704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4006  hypothetical protein  44.58 
 
 		 325 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1056  hypothetical protein  26.12 
 
 		 332 aa  91.7  1e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000661942  normal  0.66241 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0745  hypothetical protein  22.78 
 
 		 321 aa  83.2  0.000000000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3705  hypothetical protein  30.95 
 
 		 312 aa  49.7  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4521  hypothetical protein  26.47 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3303  hypothetical protein  29.32 
 
 		 294 aa  42.7  0.01  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>