15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0558 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0558  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  658    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4620  hypothetical protein  81.44 
 
 		 334 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  0.677055 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5128  hypothetical protein  50.3 
 
 		 329 aa  291  1e-77  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.933275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0439  hypothetical protein  50.59 
 
 		 332 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0442  hypothetical protein  48.8 
 
 		 332 aa  275  5e-73  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.468578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0408  hypothetical protein  48.5 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4794  hypothetical protein  48.38 
 
 		 331 aa  269  4e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07810  hypothetical protein  43.97 
 
 		 353 aa  243  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0743  hypothetical protein  43.67 
 
 		 349 aa  239  4e-62  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00643704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4006  hypothetical protein  46.86 
 
 		 325 aa  226  6e-58  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0745  hypothetical protein  25.27 
 
 		 321 aa  87.4  3e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1056  hypothetical protein  26.13 
 
 		 332 aa  85.9  8e-16  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000661942  normal  0.66241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3705  hypothetical protein  30.33 
 
 		 312 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3303  hypothetical protein  29.69 
 
 		 294 aa  45.8  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3734  hypothetical protein  28.21 
 
 		 298 aa  42.7  0.009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>