17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_0408 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0408  hypothetical protein  100 
 
 		 332 aa  659    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0442  hypothetical protein  98.49 
 
 		 332 aa  652    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.468578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0439  hypothetical protein  91.57 
 
 		 332 aa  580  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4794  hypothetical protein  87.31 
 
 		 331 aa  537  9.999999999999999e-153  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5128  hypothetical protein  54.63 
 
 		 329 aa  339  4e-92  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.933275  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4620  hypothetical protein  52.68 
 
 		 334 aa  282  5.000000000000001e-75  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  0.677055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0558  hypothetical protein  49.09 
 
 		 332 aa  268  1e-70  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0743  hypothetical protein  46.03 
 
 		 349 aa  252  5.000000000000001e-66  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00643704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07810  hypothetical protein  45.79 
 
 		 353 aa  252  7e-66  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4006  hypothetical protein  47.11 
 
 		 325 aa  241  1e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0745  hypothetical protein  27.05 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1056  hypothetical protein  23.38 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000661942  normal  0.66241 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3705  hypothetical protein  29.66 
 
 		 312 aa  58.9  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3832  hypothetical protein  24.91 
 
 		 326 aa  50.1  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2669  hypothetical protein  42.11 
 
 		 250 aa  48.9  0.0001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2263  hypothetical protein  26.56 
 
 		 257 aa  43.9  0.004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4521  hypothetical protein  20.75 
 
 		 323 aa  43.1  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>