16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_5128 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_5128  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  650    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.933275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0439  hypothetical protein  54.28 
 
 		 332 aa  335  5.999999999999999e-91  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0442  hypothetical protein  54.63 
 
 		 332 aa  325  7e-88  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.468578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4794  hypothetical protein  52.66 
 
 		 331 aa  323  2e-87  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0408  hypothetical protein  54.63 
 
 		 332 aa  322  6e-87  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4620  hypothetical protein  50.9 
 
 		 334 aa  276  5e-73  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  0.677055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0558  hypothetical protein  49.7 
 
 		 332 aa  272  5.000000000000001e-72  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07810  hypothetical protein  48.67 
 
 		 353 aa  261  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0743  hypothetical protein  48.49 
 
 		 349 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00643704  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4006  hypothetical protein  47.26 
 
 		 325 aa  238  6.999999999999999e-62  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0745  hypothetical protein  29.93 
 
 		 321 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1056  hypothetical protein  26.46 
 
 		 332 aa  96.7  5e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000661942  normal  0.66241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4521  hypothetical protein  31.25 
 
 		 323 aa  54.7  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3832  hypothetical protein  21.55 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3705  hypothetical protein  37.14 
 
 		 312 aa  45.1  0.002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3734  hypothetical protein  27.56 
 
 		 298 aa  44.7  0.002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>