17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_0745 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_0745  hypothetical protein  100 
 
 		 321 aa  661    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5128  hypothetical protein  29.71 
 
 		 329 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.933275  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0408  hypothetical protein  25.98 
 
 		 332 aa  107  3e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0442  hypothetical protein  26.33 
 
 		 332 aa  106  4e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.468578  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0439  hypothetical protein  25.98 
 
 		 332 aa  104  2e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4794  hypothetical protein  24.91 
 
 		 331 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07810  hypothetical protein  24.7 
 
 		 353 aa  96.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0743  hypothetical protein  24.3 
 
 		 349 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00643704  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1056  hypothetical protein  26.29 
 
 		 332 aa  90.9  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000661942  normal  0.66241 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4620  hypothetical protein  23.76 
 
 		 334 aa  86.7  6e-16  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  0.677055 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0558  hypothetical protein  25 
 
 		 332 aa  82.8  0.000000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4006  hypothetical protein  25.33 
 
 		 325 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4521  hypothetical protein  22.85 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2669  hypothetical protein  32.5 
 
 		 250 aa  60.5  0.00000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0573  hypothetical protein  23.96 
 
 		 298 aa  47.8  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0574  hypothetical protein  23.83 
 
 		 337 aa  44.3  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0573  hypothetical protein  23.44 
 
 		 319 aa  42.7  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>