13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_4006 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_4006  hypothetical protein  100 
 
 		 325 aa  645    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0743  hypothetical protein  49.03 
 
 		 349 aa  288  1e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  decreased coverage  0.00643704  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07810  hypothetical protein  50.49 
 
 		 353 aa  279  4e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0429131 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5128  hypothetical protein  46.63 
 
 		 329 aa  257  2e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.933275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0439  hypothetical protein  47.58 
 
 		 332 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4794  hypothetical protein  48.43 
 
 		 331 aa  249  4e-65  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.142133  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0442  hypothetical protein  46.5 
 
 		 332 aa  241  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.468578  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0408  hypothetical protein  49.12 
 
 		 332 aa  240  2e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0558  hypothetical protein  47.54 
 
 		 332 aa  227  3e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4620  hypothetical protein  46.23 
 
 		 334 aa  224  2e-57  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.47943  normal  0.677055 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0745  hypothetical protein  25.83 
 
 		 321 aa  89.7  6e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1056  hypothetical protein  27.61 
 
 		 332 aa  79.3  0.00000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000661942  normal  0.66241 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4521  hypothetical protein  29.69 
 
 		 323 aa  47.8  0.0002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>