17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfri_3509 on replicon NC_008345
Organism: Shewanella frigidimarina NCIMB 400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008345  Sfri_3509  hypothetical protein  100 
 
 		 318 aa  655    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0535  hypothetical protein  51.28 
 
 		 292 aa  290  2e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0574  hypothetical protein  42.8 
 
 		 337 aa  211  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0573  hypothetical protein  42.44 
 
 		 319 aa  210  3e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3456  hypothetical protein  42.44 
 
 		 337 aa  209  5e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0573  hypothetical protein  42.59 
 
 		 298 aa  205  8e-52  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3734  hypothetical protein  41.31 
 
 		 298 aa  200  1.9999999999999998e-50  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0534  hypothetical protein  41.31 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3791  hypothetical protein  41.83 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3917  hypothetical protein  41.31 
 
 		 298 aa  199  3.9999999999999996e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3303  hypothetical protein  39.51 
 
 		 294 aa  187  2e-46  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4325  hypothetical protein  34.77 
 
 		 297 aa  177  1e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.946347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0456  hypothetical protein  33.46 
 
 		 294 aa  177  3e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.496683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0624  hypothetical protein  32.76 
 
 		 293 aa  175  9.999999999999999e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3133  hypothetical protein  36.15 
 
 		 303 aa  161  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3705  hypothetical protein  33.96 
 
 		 312 aa  139  6e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4521  hypothetical protein  23.75 
 
 		 323 aa  65.1  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>