56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPR_0692 on replicon NC_008262
Organism: Clostridium perfringens SM101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008262  CPR_0692  chorismate mutase  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0459162  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0691  chorismate mutase  95.88 
 
 		 97 aa  186  1e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0120727  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  54.12 
 
 		 378 aa  84.7  4e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 380 aa  63.2  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  40 
 
 		 374 aa  61.6  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0661  Chorismate mutase  37.36 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  35.29 
 
 		 403 aa  55.5  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  34.83 
 
 		 90 aa  53.5  0.0000009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0540  hypothetical protein  32.56 
 
 		 91 aa  52  0.000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000524259  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1512  DAHP synthetase I/KDSA  36 
 
 		 379 aa  50.4  0.000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2509  hypothetical protein  34.07 
 
 		 90 aa  49.7  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.77 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.77 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.77 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.77 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.77 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.77 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.77 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  33.77 
 
 		 360 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  32.47 
 
 		 360 aa  47  0.00008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  33.77 
 
 		 360 aa  47  0.00008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.47 
 
 		 360 aa  47  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.77 
 
 		 360 aa  47  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  33.77 
 
 		 360 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  33.77 
 
 		 360 aa  46.6  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  33.77 
 
 		 360 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  33.77 
 
 		 360 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  33.77 
 
 		 362 aa  46.2  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  41.07 
 
 		 387 aa  46.2  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  33.77 
 
 		 360 aa  46.2  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1940  DAHP synthetase I/KDSA  35.71 
 
 		 363 aa  45.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0470  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  39.06 
 
 		 363 aa  44.7  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  39.62 
 
 		 382 aa  44.7  0.0005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  34.29 
 
 		 381 aa  44.3  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5731  DAHP synthetase I/KDSA  25.3 
 
 		 367 aa  44.3  0.0006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157799  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  30.34 
 
 		 358 aa  44.3  0.0006  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  34 
 
 		 103 aa  43.9  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.15 
 
 		 360 aa  43.5  0.0009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  32.14 
 
 		 379 aa  42.7  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  30.34 
 
 		 358 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  30.34 
 
 		 358 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  32.93 
 
 		 360 aa  43.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  39.66 
 
 		 363 aa  42.7  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  32.69 
 
 		 294 aa  42  0.003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  36.36 
 
 		 359 aa  41.6  0.003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  34 
 
 		 98 aa  41.6  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  40 
 
 		 359 aa  41.2  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  36 
 
 		 358 aa  41.2  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4394  DAHP synthetase I/KDSA  25.81 
 
 		 364 aa  41.2  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.429892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  29.87 
 
 		 379 aa  41.2  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  37.88 
 
 		 385 aa  40.8  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0808  3-dehydroquinate dehydratase, type I  36.54 
 
 		 295 aa  40.4  0.008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.716383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  30.77 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1686  chorismate mutase / prephenate dehydratase  33.77 
 
 		 355 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  34.62 
 
 		 356 aa  40.4  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2513  Chorismate mutase  26.83 
 
 		 107 aa  40  0.009  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.514651  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>