35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apar_0661 on replicon NC_013203
Organism: Atopobium parvulum DSM 20469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013203  Apar_0661  Chorismate mutase  100 
 
 		 90 aa  179  1e-44  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0692  chorismate mutase  37.36 
 
 		 97 aa  60.8  0.000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0459162  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0691  chorismate mutase  38.37 
 
 		 97 aa  59.7  0.00000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0120727  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 380 aa  53.1  0.000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0540  hypothetical protein  45 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000524259  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  51.06 
 
 		 359 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  36.71 
 
 		 379 aa  48.9  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0121  prephenate dehydratase  40.74 
 
 		 356 aa  48.9  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2509  hypothetical protein  43.75 
 
 		 90 aa  47.8  0.00005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0654  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  42 
 
 		 377 aa  45.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1278  chorismate mutase  30.77 
 
 		 346 aa  43.5  0.0009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1940  DAHP synthetase I/KDSA  42.55 
 
 		 363 aa  43.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  44.19 
 
 		 103 aa  43.1  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  38 
 
 		 374 aa  43.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1371  chorismate mutase related enzyme  30.67 
 
 		 97 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  28.57 
 
 		 403 aa  43.1  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  36.51 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00993  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  38 
 
 		 375 aa  42.4  0.002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004405  chorismate mutase I/cyclohexadienyl dehydrogenase  38 
 
 		 375 aa  42.4  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0546  class I/II aminotransferase  33.73 
 
 		 456 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  40.38 
 
 		 360 aa  41.6  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0885  phospho-2-dehydro-3-deoxyheptonate aldolase/chorismate mutase  39.62 
 
 		 366 aa  41.6  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1068  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  33.33 
 
 		 384 aa  41.6  0.004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0518794  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1875  Chorismate mutase  39.29 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.890024  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2335  Chorismate mutase  39.29 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1588  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34 
 
 		 375 aa  40.8  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1352  chorismate mutase  40.48 
 
 		 96 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.926443  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2192  chorismate mutase  41.07 
 
 		 355 aa  40.4  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1313  chorismate mutase  42.55 
 
 		 359 aa  40.4  0.008  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.21838e-16 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3096  chorismate mutase  28.57 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2241  prephenate dehydratase / chorismate mutase  28.21 
 
 		 370 aa  40  0.009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4074  chorismate mutase  27.5 
 
 		 106 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  34.85 
 
 		 374 aa  40  0.01  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3751  chorismate mutase  28.57 
 
 		 106 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.286554  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>