58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0691 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0691  chorismate mutase  100 
 
 		 97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0120727  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0692  chorismate mutase  95.88 
 
 		 97 aa  186  1e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0459162  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2375  chorismate mutase  54.12 
 
 		 378 aa  85.5  2e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0783  prephenate dehydratase  36.36 
 
 		 380 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0793  chorismate mutase  40.45 
 
 		 374 aa  62.4  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  5.66734e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0661  Chorismate mutase  38.37 
 
 		 90 aa  59.7  0.00000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10160  monofunctional chorismate mutase, clade 2  34.12 
 
 		 403 aa  53.5  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000617885  hitchhiker  0.000000765088 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1146  hypothetical protein  34.09 
 
 		 90 aa  51.6  0.000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0377196  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1512  DAHP synthetase I/KDSA  36 
 
 		 379 aa  50.8  0.000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.659236 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0540  hypothetical protein  32.56 
 
 		 91 aa  50.8  0.000006  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.0000524259  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2885  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.22 
 
 		 360 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.629426  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0432  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.22 
 
 		 360 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2575  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.22 
 
 		 360 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0950  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.22 
 
 		 360 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2948  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.22 
 
 		 360 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.457884  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1635  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.22 
 
 		 360 aa  48.9  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0198  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.22 
 
 		 360 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2997  chorismate mutase/prephenate dehydratase  32.22 
 
 		 360 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379619  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0741  chorismate mutase  33.77 
 
 		 360 aa  46.2  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2261  chorismate mutase  33.77 
 
 		 360 aa  46.6  0.0001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.561054  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1002  chorismate mutase  33.77 
 
 		 360 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3006  chorismate mutase  32.47 
 
 		 360 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.224868  normal  0.0525817 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0977  prephenate dehydratase / chorismate mutase  32.47 
 
 		 360 aa  46.6  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.23904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4156  prephenate dehydratase / chorismate mutase  33.77 
 
 		 360 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.757086 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2509  hypothetical protein  32.97 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1043  chorismate mutase  33.77 
 
 		 360 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2513  Chorismate mutase  27.47 
 
 		 107 aa  46.2  0.0002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.514651  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0919  chorismate mutase  33.77 
 
 		 360 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0585516  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1940  DAHP synthetase I/KDSA  35.71 
 
 		 363 aa  45.4  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0564  chorismate mutase  33.77 
 
 		 362 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0923  chorismate mutase  33.77 
 
 		 360 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.432858 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2723  chorismate mutase  34.29 
 
 		 381 aa  44.7  0.0004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0716  prephenate dehydratase / chorismate mutase  39.29 
 
 		 387 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0470  chorismate mutase, gamma, beta and epsilon  39.06 
 
 		 363 aa  45.1  0.0004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5731  DAHP synthetase I/KDSA  25.3 
 
 		 367 aa  44.7  0.0004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.157799  normal  0.124259 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1792  chorismate mutase / prephenate dehydratase  34.15 
 
 		 360 aa  44.3  0.0006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00027177 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1828  chorismate mutase domain-containing protein  34 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.215612  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1345  prephenate dehydratase  41.67 
 
 		 379 aa  43.9  0.0007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2793  chorismate mutase  32.93 
 
 		 360 aa  43.9  0.0007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163655 
 
 
-
 
NC_002936  DET0461  chorismate mutase/prephenate dehydratase  29.21 
 
 		 358 aa  43.5  0.0009  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.123975  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1232  prephenate dehydratase  39.66 
 
 		 363 aa  42.7  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.964016 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2575  prephenate dehydratase  37.74 
 
 		 382 aa  42.7  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0965398  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0438  prephenate dehydratase / chorismate mutase  29.21 
 
 		 358 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000533391  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_404  chorismate mutase / prephenate dehydratase  29.21 
 
 		 358 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000273444  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1345  chorismate mutase  40 
 
 		 359 aa  41.6  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1955  chorismate mutase  34 
 
 		 98 aa  41.2  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00612945  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0801  chorismate mutase  36.36 
 
 		 359 aa  41.2  0.005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3487  prephenate dehydratase  29.87 
 
 		 379 aa  40.8  0.006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1641  prephenate dehydratase  34.62 
 
 		 356 aa  40.8  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00696734  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4394  DAHP synthetase I/KDSA  26.14 
 
 		 364 aa  40.8  0.007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.429892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0911  chorismate mutase  30.77 
 
 		 294 aa  40.8  0.007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2150  chorismate mutase  34.67 
 
 		 358 aa  40.4  0.008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1875  Chorismate mutase  32 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.890024  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0671  bifunctional chorismate mutase/prephenate dehydrogenase  35.85 
 
 		 374 aa  40.4  0.008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.106766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2335  Chorismate mutase  32 
 
 		 91 aa  40.4  0.009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0719  3-deoxy-7-phosphoheptulonate synthase  34.92 
 
 		 368 aa  40.4  0.009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0009  chorismate mutase  37.88 
 
 		 385 aa  40.4  0.009  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0495  chorismate mutase  30.77 
 
 		 359 aa  40  0.01  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0778684  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>