22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_0428 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_0428  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  890    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.397045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0423  hypothetical protein  98.83 
 
 		 427 aa  882    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1719  hypothetical protein  50.95 
 
 		 427 aa  436  1e-121  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3674  hypothetical protein  50.24 
 
 		 470 aa  432  1e-120  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0875618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1069  hypothetical protein  49.03 
 
 		 477 aa  416  9.999999999999999e-116  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0200  hypothetical protein  46.41 
 
 		 432 aa  397  1e-109  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.468077  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2716  hypothetical protein  48.91 
 
 		 487 aa  394  1e-108  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0529181  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0150  hypothetical protein  47.61 
 
 		 426 aa  392  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4613  hypothetical protein  46.45 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3991  hypothetical protein  41.12 
 
 		 448 aa  385  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4291  hypothetical protein  46.91 
 
 		 476 aa  383  1e-105  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4029  hypothetical protein  43.16 
 
 		 475 aa  380  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.500538  normal  0.302353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01628  hypothetical protein  43.26 
 
 		 487 aa  371  1e-101  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0543327  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28450  hypothetical protein  46.67 
 
 		 457 aa  363  3e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.728185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3735  hypothetical protein  44.58 
 
 		 451 aa  363  4e-99  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383228  decreased coverage  0.00219204 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2420  twin-arginine translocation pathway signal  43.9 
 
 		 480 aa  332  6e-90  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.226342  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48341  predicted protein  41.52 
 
 		 566 aa  298  1e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32486  predicted protein  38.1 
 
 		 603 aa  253  4.0000000000000004e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209404  normal  0.436632 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07307  DUF1237 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16720)  34.08 
 
 		 523 aa  247  2e-64  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39269  predicted protein  36.48 
 
 		 554 aa  241  2e-62  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0041  hypothetical protein  26.4 
 
 		 570 aa  49.7  0.0001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0676  hypothetical protein  25.91 
 
 		 597 aa  43.1  0.009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.11707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>