22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Apre_0150 on replicon NC_013171
Organism: Anaerococcus prevotii DSM 20548



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013171  Apre_0150  hypothetical protein  100 
 
 
426 aa  879    Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0428  hypothetical protein  47.61 
 
 
427 aa  392  1e-108  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.397045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0423  hypothetical protein  47.13 
 
 
427 aa  389  1e-107  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0200  hypothetical protein  46.48 
 
 
432 aa  378  1e-103  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.468077  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1719  hypothetical protein  45.24 
 
 
427 aa  366  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3991  hypothetical protein  39.67 
 
 
448 aa  328  9e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28450  hypothetical protein  41.49 
 
 
457 aa  327  2.0000000000000001e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.728185  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3674  hypothetical protein  41.98 
 
 
470 aa  316  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0875618  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4029  hypothetical protein  40.45 
 
 
475 aa  316  6e-85  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.500538  normal  0.302353 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4613  hypothetical protein  41.25 
 
 
427 aa  307  3e-82  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2716  hypothetical protein  40.39 
 
 
487 aa  298  2e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0529181  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1069  hypothetical protein  37.68 
 
 
477 aa  297  2e-79  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4291  hypothetical protein  39.26 
 
 
476 aa  298  2e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01628  hypothetical protein  36.45 
 
 
487 aa  290  4e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0543327  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3735  hypothetical protein  40.89 
 
 
451 aa  289  6e-77  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383228  decreased coverage  0.00219204 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48341  predicted protein  37.3 
 
 
566 aa  252  9.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2420  twin-arginine translocation pathway signal  35.56 
 
 
480 aa  247  3e-64  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.226342  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32486  predicted protein  35.19 
 
 
603 aa  226  6e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209404  normal  0.436632 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39269  predicted protein  35.31 
 
 
554 aa  218  2e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07307  DUF1237 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16720)  30.89 
 
 
523 aa  216  8e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0041  hypothetical protein  28.74 
 
 
570 aa  57  0.0000007  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0676  hypothetical protein  32.54 
 
 
597 aa  52.8  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.11707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>