21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_28450 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013172  Bfae_28450  hypothetical protein  100 
 
 		 457 aa  924    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.728185  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0200  hypothetical protein  45.33 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.468077  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3991  hypothetical protein  49.76 
 
 		 448 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1719  hypothetical protein  45.61 
 
 		 427 aa  372  1e-102  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0428  hypothetical protein  46.67 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.397045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0423  hypothetical protein  45.22 
 
 		 427 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4613  hypothetical protein  48.77 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0150  hypothetical protein  41.49 
 
 		 426 aa  334  2e-90  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3735  hypothetical protein  48.25 
 
 		 451 aa  323  4e-87  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383228  decreased coverage  0.00219204 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3674  hypothetical protein  41.23 
 
 		 470 aa  316  5e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0875618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4029  hypothetical protein  43 
 
 		 475 aa  313  2.9999999999999996e-84  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.500538  normal  0.302353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1069  hypothetical protein  40.77 
 
 		 477 aa  313  3.9999999999999997e-84  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4291  hypothetical protein  42.11 
 
 		 476 aa  304  2.0000000000000002e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2716  hypothetical protein  41.4 
 
 		 487 aa  295  8e-79  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0529181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01628  hypothetical protein  42.96 
 
 		 487 aa  291  1e-77  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0543327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2420  twin-arginine translocation pathway signal  42.79 
 
 		 480 aa  271  2e-71  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.226342  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48341  predicted protein  36.57 
 
 		 566 aa  254  2.0000000000000002e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07307  DUF1237 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16720)  34.67 
 
 		 523 aa  230  4e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39269  predicted protein  34.14 
 
 		 554 aa  209  6e-53  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32486  predicted protein  33.82 
 
 		 603 aa  195  1e-48  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209404  normal  0.436632 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0041  hypothetical protein  30.6 
 
 		 570 aa  55.5  0.000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>