20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32486 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_32486  predicted protein  100 
 
 
603 aa  1255    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209404  normal  0.436632 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07307  DUF1237 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16720)  51.46 
 
 
523 aa  493  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4029  hypothetical protein  39.33 
 
 
475 aa  333  8e-90  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.500538  normal  0.302353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2716  hypothetical protein  39.01 
 
 
487 aa  330  4e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0529181  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1069  hypothetical protein  38.53 
 
 
477 aa  318  2e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4291  hypothetical protein  37.45 
 
 
476 aa  312  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3674  hypothetical protein  39.52 
 
 
470 aa  307  4.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0875618  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01628  hypothetical protein  35.31 
 
 
487 aa  287  4e-76  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0543327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2420  twin-arginine translocation pathway signal  36.23 
 
 
480 aa  265  1e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.226342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0428  hypothetical protein  38.1 
 
 
427 aa  253  6e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.397045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0423  hypothetical protein  38.1 
 
 
427 aa  253  7e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0200  hypothetical protein  33.12 
 
 
432 aa  233  9e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.468077  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1719  hypothetical protein  33.84 
 
 
427 aa  230  5e-59  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0150  hypothetical protein  35.19 
 
 
426 aa  226  9e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48341  predicted protein  33.48 
 
 
566 aa  214  3.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3991  hypothetical protein  33.75 
 
 
448 aa  213  7.999999999999999e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4613  hypothetical protein  33.41 
 
 
427 aa  204  3e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28450  hypothetical protein  33.33 
 
 
457 aa  194  3e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.728185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3735  hypothetical protein  33.92 
 
 
451 aa  193  9e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383228  decreased coverage  0.00219204 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39269  predicted protein  33.25 
 
 
554 aa  183  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>