20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1069 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1069  hypothetical protein  100 
 
 		 477 aa  997    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2716  hypothetical protein  56.08 
 
 		 487 aa  572  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0529181  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4029  hypothetical protein  57.65 
 
 		 475 aa  563  1.0000000000000001e-159  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.500538  normal  0.302353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4291  hypothetical protein  56.07 
 
 		 476 aa  559  1e-158  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3674  hypothetical protein  58.18 
 
 		 470 aa  533  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0875618  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01628  hypothetical protein  51.13 
 
 		 487 aa  498  1e-139  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0543327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2420  twin-arginine translocation pathway signal  48.98 
 
 		 480 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.226342  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0423  hypothetical protein  49.03 
 
 		 427 aa  415  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0428  hypothetical protein  49.03 
 
 		 427 aa  416  9.999999999999999e-116  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.397045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1719  hypothetical protein  44.63 
 
 		 427 aa  377  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3991  hypothetical protein  41.89 
 
 		 448 aa  356  5.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0200  hypothetical protein  41.45 
 
 		 432 aa  331  2e-89  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.468077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4613  hypothetical protein  37.77 
 
 		 427 aa  323  5e-87  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32486  predicted protein  38.53 
 
 		 603 aa  318  2e-85  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209404  normal  0.436632 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07307  DUF1237 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16720)  36.15 
 
 		 523 aa  303  3.0000000000000004e-81  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28450  hypothetical protein  40.77 
 
 		 457 aa  302  8.000000000000001e-81  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.728185  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0150  hypothetical protein  37.68 
 
 		 426 aa  297  2e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3735  hypothetical protein  40 
 
 		 451 aa  295  2e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383228  decreased coverage  0.00219204 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48341  predicted protein  36.82 
 
 		 566 aa  251  2e-65  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39269  predicted protein  30.1 
 
 		 554 aa  171  3e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>