20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_3991 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_3991  hypothetical protein  100 
 
 
448 aa  905    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4613  hypothetical protein  55.28 
 
 
427 aa  418  9.999999999999999e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0428  hypothetical protein  41.12 
 
 
427 aa  385  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.397045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0423  hypothetical protein  41.12 
 
 
427 aa  386  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3735  hypothetical protein  52.78 
 
 
451 aa  379  1e-104  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383228  decreased coverage  0.00219204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28450  hypothetical protein  49.76 
 
 
457 aa  366  1e-100  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.728185  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0200  hypothetical protein  48.29 
 
 
432 aa  362  6e-99  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.468077  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1719  hypothetical protein  45.74 
 
 
427 aa  358  9.999999999999999e-98  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3674  hypothetical protein  43.2 
 
 
470 aa  357  1.9999999999999998e-97  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0875618  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1069  hypothetical protein  41.89 
 
 
477 aa  356  5e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4291  hypothetical protein  42.36 
 
 
476 aa  341  2e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4029  hypothetical protein  42.75 
 
 
475 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.500538  normal  0.302353 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01628  hypothetical protein  43.57 
 
 
487 aa  329  7e-89  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0543327  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0150  hypothetical protein  39.67 
 
 
426 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2716  hypothetical protein  40.49 
 
 
487 aa  319  6e-86  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0529181  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2420  twin-arginine translocation pathway signal  44.28 
 
 
480 aa  309  5.9999999999999995e-83  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.226342  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48341  predicted protein  38.58 
 
 
566 aa  258  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07307  DUF1237 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16720)  31.43 
 
 
523 aa  223  7e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39269  predicted protein  35.11 
 
 
554 aa  214  2.9999999999999995e-54  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32486  predicted protein  33.75 
 
 
603 aa  213  4.9999999999999996e-54  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209404  normal  0.436632 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>