20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2420 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2420  twin-arginine translocation pathway signal  100 
 
 		 480 aa  974    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.226342  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01628  hypothetical protein  61.07 
 
 		 487 aa  550  1e-155  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0543327  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4029  hypothetical protein  51.05 
 
 		 475 aa  469  1.0000000000000001e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.500538  normal  0.302353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4291  hypothetical protein  52.03 
 
 		 476 aa  468  1.0000000000000001e-131  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1069  hypothetical protein  46.86 
 
 		 477 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2716  hypothetical protein  49.55 
 
 		 487 aa  456  1e-127  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0529181  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3674  hypothetical protein  51.8 
 
 		 470 aa  456  1e-127  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0875618  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0428  hypothetical protein  43.93 
 
 		 427 aa  350  3e-95  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.397045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0423  hypothetical protein  43.69 
 
 		 427 aa  349  7e-95  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3991  hypothetical protein  44.74 
 
 		 448 aa  330  5.0000000000000004e-89  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0200  hypothetical protein  38.92 
 
 		 432 aa  295  2e-78  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.468077  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1719  hypothetical protein  37.39 
 
 		 427 aa  292  9e-78  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28450  hypothetical protein  42.05 
 
 		 457 aa  277  3e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.728185  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32486  predicted protein  36.86 
 
 		 603 aa  276  6e-73  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209404  normal  0.436632 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3735  hypothetical protein  40.18 
 
 		 451 aa  274  2.0000000000000002e-72  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383228  decreased coverage  0.00219204 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07307  DUF1237 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16720)  36.82 
 
 		 523 aa  270  4e-71  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4613  hypothetical protein  40.9 
 
 		 427 aa  269  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0150  hypothetical protein  36.05 
 
 		 426 aa  261  3e-68  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48341  predicted protein  35 
 
 		 566 aa  219  1e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39269  predicted protein  34.18 
 
 		 554 aa  169  7e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>