21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_3674 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008009  Acid345_3674  hypothetical protein  100 
 
 
470 aa  979    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0875618  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4029  hypothetical protein  59.44 
 
 
475 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.500538  normal  0.302353 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1069  hypothetical protein  58.18 
 
 
477 aa  533  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2716  hypothetical protein  57.24 
 
 
487 aa  518  1e-146  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0529181  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4291  hypothetical protein  55.82 
 
 
476 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01628  hypothetical protein  54.55 
 
 
487 aa  508  9.999999999999999e-143  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0543327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2420  twin-arginine translocation pathway signal  53.36 
 
 
480 aa  436  1e-121  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.226342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0428  hypothetical protein  50.24 
 
 
427 aa  432  1e-120  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.397045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0423  hypothetical protein  50.49 
 
 
427 aa  433  1e-120  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1719  hypothetical protein  44.58 
 
 
427 aa  378  1e-103  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3991  hypothetical protein  43.2 
 
 
448 aa  357  1.9999999999999998e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0200  hypothetical protein  43.86 
 
 
432 aa  345  8e-94  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.468077  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4613  hypothetical protein  42.96 
 
 
427 aa  338  9.999999999999999e-92  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0150  hypothetical protein  41.98 
 
 
426 aa  316  5e-85  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07307  DUF1237 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16720)  38.79 
 
 
523 aa  314  1.9999999999999998e-84  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3735  hypothetical protein  42.96 
 
 
451 aa  308  2.0000000000000002e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383228  decreased coverage  0.00219204 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28450  hypothetical protein  41.23 
 
 
457 aa  308  2.0000000000000002e-82  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.728185  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32486  predicted protein  39.52 
 
 
603 aa  307  3e-82  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209404  normal  0.436632 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48341  predicted protein  40.55 
 
 
566 aa  277  3e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39269  predicted protein  30.45 
 
 
554 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0041  hypothetical protein  31.2 
 
 
570 aa  52  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>