21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_4291 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013730  Slin_4029  hypothetical protein  67.3 
 
 
475 aa  676    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.500538  normal  0.302353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4291  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  988    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2716  hypothetical protein  58.18 
 
 
487 aa  573  1.0000000000000001e-162  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0529181  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1069  hypothetical protein  56.07 
 
 
477 aa  566  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3674  hypothetical protein  55.82 
 
 
470 aa  520  1e-146  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0875618  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01628  hypothetical protein  52.21 
 
 
487 aa  485  1e-136  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0543327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2420  twin-arginine translocation pathway signal  51.58 
 
 
480 aa  450  1e-125  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.226342  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0428  hypothetical protein  46.91 
 
 
427 aa  383  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.397045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0423  hypothetical protein  47.16 
 
 
427 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1719  hypothetical protein  42.22 
 
 
427 aa  345  7e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3991  hypothetical protein  42.36 
 
 
448 aa  341  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07307  DUF1237 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16720)  38.04 
 
 
523 aa  323  5e-87  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32486  predicted protein  37.45 
 
 
603 aa  311  1e-83  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209404  normal  0.436632 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4613  hypothetical protein  38.57 
 
 
427 aa  310  5e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0150  hypothetical protein  39.26 
 
 
426 aa  298  1e-79  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0200  hypothetical protein  40.45 
 
 
432 aa  296  5e-79  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.468077  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28450  hypothetical protein  42.11 
 
 
457 aa  291  2e-77  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.728185  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3735  hypothetical protein  38.77 
 
 
451 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383228  decreased coverage  0.00219204 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48341  predicted protein  35.15 
 
 
566 aa  234  2.0000000000000002e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39269  predicted protein  29.44 
 
 
554 aa  160  7e-38  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0041  hypothetical protein  25.12 
 
 
570 aa  50.1  0.00008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>