20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_4613 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_4613  hypothetical protein  100 
 
 		 427 aa  856    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3991  hypothetical protein  55.28 
 
 		 448 aa  418  1e-116  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3735  hypothetical protein  59.95 
 
 		 451 aa  415  9.999999999999999e-116  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383228  decreased coverage  0.00219204 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0428  hypothetical protein  46.45 
 
 		 427 aa  387  1e-106  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.397045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0423  hypothetical protein  46.45 
 
 		 427 aa  388  1e-106  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0200  hypothetical protein  46.35 
 
 		 432 aa  356  5.999999999999999e-97  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.468077  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1719  hypothetical protein  44.33 
 
 		 427 aa  352  8.999999999999999e-96  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3674  hypothetical protein  42.96 
 
 		 470 aa  338  9.999999999999999e-92  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0875618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28450  hypothetical protein  48.77 
 
 		 457 aa  337  2.9999999999999997e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.728185  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1069  hypothetical protein  37.77 
 
 		 477 aa  323  5e-87  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4291  hypothetical protein  39.19 
 
 		 476 aa  310  4e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0150  hypothetical protein  41.25 
 
 		 426 aa  307  3e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4029  hypothetical protein  38.82 
 
 		 475 aa  305  1.0000000000000001e-81  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.500538  normal  0.302353 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2716  hypothetical protein  39.19 
 
 		 487 aa  303  4.0000000000000003e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0529181  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01628  hypothetical protein  40.71 
 
 		 487 aa  296  7e-79  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0543327  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2420  twin-arginine translocation pathway signal  39.42 
 
 		 480 aa  256  5e-67  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.226342  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48341  predicted protein  36.15 
 
 		 566 aa  256  6e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07307  DUF1237 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16720)  35.7 
 
 		 523 aa  213  3.9999999999999995e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32486  predicted protein  33.41 
 
 		 603 aa  204  2e-51  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209404  normal  0.436632 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39269  predicted protein  34.12 
 
 		 554 aa  203  5e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>