21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1719 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1719  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  893    Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0200  hypothetical protein  50.82 
 
 
432 aa  439  9.999999999999999e-123  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.468077  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0428  hypothetical protein  50.95 
 
 
427 aa  436  1e-121  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.397045  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0423  hypothetical protein  50.24 
 
 
427 aa  431  1e-119  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1069  hypothetical protein  44.63 
 
 
477 aa  377  1e-103  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3674  hypothetical protein  44.58 
 
 
470 aa  378  1e-103  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0875618  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2716  hypothetical protein  44.79 
 
 
487 aa  367  1e-100  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0529181  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0150  hypothetical protein  45.24 
 
 
426 aa  366  1e-100  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_28450  hypothetical protein  45.61 
 
 
457 aa  362  5.0000000000000005e-99  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.728185  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3991  hypothetical protein  45.74 
 
 
448 aa  358  9.999999999999999e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4613  hypothetical protein  44.33 
 
 
427 aa  352  8.999999999999999e-96  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4029  hypothetical protein  41.43 
 
 
475 aa  347  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.500538  normal  0.302353 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4291  hypothetical protein  42.22 
 
 
476 aa  345  8e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3735  hypothetical protein  41.87 
 
 
451 aa  337  1.9999999999999998e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.383228  decreased coverage  0.00219204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01628  hypothetical protein  38.06 
 
 
487 aa  312  5.999999999999999e-84  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0543327  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48341  predicted protein  40.87 
 
 
566 aa  300  3e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2420  twin-arginine translocation pathway signal  37.39 
 
 
480 aa  282  7.000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.226342  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07307  DUF1237 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_2G16720)  34.42 
 
 
523 aa  251  1e-65  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32486  predicted protein  33.84 
 
 
603 aa  230  3e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.209404  normal  0.436632 
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_39269  predicted protein  32.36 
 
 
554 aa  208  1e-52  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0041  hypothetical protein  25.52 
 
 
570 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>