47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00540 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF03050    96.84 
 
 		 2400 bp  2579    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    98.84 
 
 		 9432 bp  2771    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01990    97.28 
 
 		 4092 bp  5067    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02040    97.68 
 
 		 5451 bp  7765    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0657363  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02930    97.79 
 
 		 6690 bp  4992    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.248391  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02950    98.92 
 
 		 3657 bp  4920    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.565441  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02970    98.17 
 
 		 3063 bp  5622    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.161059  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03000    99.07 
 
 		 6462 bp  4952    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03040    96.43 
 
 		 6606 bp  4143    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03640    100 
 
 		 6336 bp  10460    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03080    98.03 
 
 		 6546 bp  9850    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.589577  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03090    98.27 
 
 		 579 bp  1068    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.598355  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    99.01 
 
 		 5637 bp  5402    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03190    96.74 
 
 		 4905 bp  1746    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  unclonable  0.000000117128  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    96.02 
 
 		 3186 bp  922    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01470    97.87 
 
 		 1707 bp  3061    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0419908  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    98.47 
 
 		 12648 bp  9819    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  97.94 
 
 		 4245 bp  6968    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02800    98.71 
 
 		 5544 bp  8144    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02820    96.98 
 
 		 1773 bp  1039    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    97.59 
 
 		 7809 bp  5592    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    94.66 
 
 		 7164 bp  3816    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    98.45 
 
 		 5499 bp  9811    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03630    97.79 
 
 		 1917 bp  2048    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664916  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00520    96.99 
 
 		 534 bp  926    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0038147  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    100 
 
 		 10638 bp  21090    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03280  hypothetical protein  81.76 
 
 		 1307 bp  262  2.0000000000000002e-66  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.168835  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01460    100 
 
 		 2397 bp  216  1e-52  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0805614  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02780    97.32 
 
 		 7383 bp  198  2e-47  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    97.2 
 
 		 11454 bp  188  2e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00490    90 
 
 		 5811 bp  143  9.999999999999999e-31  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0199944  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03060    79.14 
 
 		 4713 bp  115  3e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710679  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02990    85.5 
 
 		 4911 bp  109  2e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000623592  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00530    78.86 
 
 		 4734 bp  107  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0903388  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02030    78.86 
 
 		 4377 bp  107  7e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346684  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01270    81.91 
 
 		 2262 bp  103  1e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.280012  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02950    84.73 
 
 		 5775 bp  101  4e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0398404  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02050    83.97 
 
 		 3573 bp  93.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250754  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03110    80.09 
 
 		 825 bp  91.7  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.87032  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01480    78.29 
 
 		 12126 bp  91.7  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.363818  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  84.43 
 
 		 4575 bp  91.7  0.000000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00520    83.21 
 
 		 4542 bp  85.7  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285744  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03030    82.09 
 
 		 7155 bp  75.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.566664  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03670    95.65 
 
 		 1830 bp  75.8  0.0000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0490526  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02860    81.25 
 
 		 1383 bp  63.9  0.0000009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00510    91.49 
 
 		 3126 bp  61.9  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0721861  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01280    85.51 
 
 		 1829 bp  58  0.00006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>