12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNI01270 on replicon NC_006694
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA05340  transposable element- crypton-Cn1, putative  93.36 
 
 
2984 bp  2535    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01270    100 
 
 
2262 bp  4484    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.280012  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03640    81.91 
 
 
6336 bp  103  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    81.91 
 
 
10638 bp  103  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    80.85 
 
 
5499 bp  87.7  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02950    80.85 
 
 
3657 bp  87.7  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.565441  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03000    80.85 
 
 
6462 bp  87.7  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    80.85 
 
 
5637 bp  87.7  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    80.85 
 
 
12648 bp  87.7  0.00000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03280  hypothetical protein  92.86 
 
 
1307 bp  60  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.168835  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  100 
 
 
4575 bp  58  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF01010    90.24 
 
 
3301 bp  50.1  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
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