41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE02990 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006680  CNK00510    97.66 
 
 
5559 bp  2817    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748048  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02030    95.57 
 
 
4377 bp  6290    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346684  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02050    96.34 
 
 
3573 bp  4298    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250754  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03620    96.34 
 
 
1755 bp  811    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124458  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02000    97.43 
 
 
5844 bp  874    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02950    96.93 
 
 
5775 bp  4411    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0398404  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00550    98.37 
 
 
1743 bp  888    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02990    100 
 
 
4911 bp  9735    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000623592  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00530    95.53 
 
 
4734 bp  7466    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0903388  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00510    97.34 
 
 
3126 bp  2728    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0721861  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    92.24 
 
 
7164 bp  3473    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00520    95.85 
 
 
4542 bp  3981    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285744  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01480    96.98 
 
 
12126 bp  8211    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.363818  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    95.17 
 
 
11454 bp  7468    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02780    97.73 
 
 
7383 bp  779    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    97.61 
 
 
7809 bp  896    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03030    86.19 
 
 
7155 bp  1029    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.566664  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03670    95.25 
 
 
1830 bp  2841    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0490526  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03050    98.17 
 
 
2400 bp  690    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03650    97.3 
 
 
4674 bp  5313    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03060    95.17 
 
 
4713 bp  6714    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710679  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02860    84.74 
 
 
1383 bp  622  1e-175  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    94.86 
 
 
3186 bp  452  1.0000000000000001e-124  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02020    99.46 
 
 
2097 bp  357  2e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.602366  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02940    99.46 
 
 
4674 bp  357  2e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0953543  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    99.46 
 
 
9432 bp  357  2e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03660    99.46 
 
 
5538 bp  357  2e-95  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02960    98.91 
 
 
1323 bp  349  5e-93  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  hitchhiker  0.00543599  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03120    90.91 
 
 
2895 bp  325  7e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03110    80.94 
 
 
825 bp  321  9.999999999999999e-85  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.87032  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02930    96.41 
 
 
5061 bp  276  5.9999999999999995e-71  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108967  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02530  hypothetical protein  81.93 
 
 
1581 bp  131  2e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.857331  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02950    85.5 
 
 
3657 bp  109  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.565441  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    85.5 
 
 
10638 bp  109  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03000    85.5 
 
 
6462 bp  109  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03640    85.5 
 
 
6336 bp  109  8e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    84.73 
 
 
5499 bp  101  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    84.73 
 
 
5637 bp  101  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02010    100 
 
 
3753 bp  63.9  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.788594  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01290    93.02 
 
 
2966 bp  61.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02820    81.73 
 
 
1773 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
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