26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00550 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Replicon accession

Locus tag

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006683  CNN02000    97.14 
 
 
5844 bp  821    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01290    97.16 
 
 
2966 bp  737    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01480    98.92 
 
 
12126 bp  1380    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.363818  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03060    99.41 
 
 
4713 bp  985    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710679  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03050    99.73 
 
 
2400 bp  722    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02990    98.37 
 
 
4911 bp  888    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000623592  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02950    97.51 
 
 
5775 bp  989    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0398404  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02050    96.43 
 
 
3573 bp  944    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250754  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02030    99.61 
 
 
4377 bp  1005    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346684  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03620    95.54 
 
 
1755 bp  769    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124458  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00550    100 
 
 
1743 bp  3455    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00530    96.04 
 
 
4734 bp  690    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0903388  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00510    96.47 
 
 
3126 bp  745    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0721861  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    99.64 
 
 
7164 bp  1094    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00510    97.44 
 
 
5559 bp  726    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748048  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    95.89 
 
 
11454 bp  1219    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    98.16 
 
 
7809 bp  884    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    98.12 
 
 
12648 bp  464  9.999999999999999e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    94.54 
 
 
3186 bp  430  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03120    90.98 
 
 
2895 bp  313  9e-83  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00520    92.86 
 
 
4542 bp  278  5.000000000000001e-72  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285744  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03650    97.62 
 
 
4674 bp  218  3.9999999999999995e-54  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    90.24 
 
 
10638 bp  50.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    90.24 
 
 
5499 bp  50.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    90.24 
 
 
5637 bp  50.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03640    90.24 
 
 
6336 bp  50.1  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
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