38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03100 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA03640    98.99 
 
 
6336 bp  6007    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02930    98.38 
 
 
6690 bp  803    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.248391  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02950    98.57 
 
 
3657 bp  4308    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.565441  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    99.01 
 
 
10638 bp  5402    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03000    98.74 
 
 
6462 bp  4339    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    100 
 
 
5637 bp  11180    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02820    96.81 
 
 
1773 bp  1031    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    98.64 
 
 
12648 bp  5921    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    98.73 
 
 
5499 bp  5755    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03280  hypothetical protein  85.67 
 
 
1307 bp  293  2.9999999999999996e-76  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.168835  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03060    79.66 
 
 
4713 bp  107  4e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710679  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02990    84.73 
 
 
4911 bp  101  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000623592  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03110    80.53 
 
 
825 bp  99.6  9e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.87032  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02950    83.97 
 
 
5775 bp  93.7  5e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0398404  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00520    78.97 
 
 
4542 bp  91.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285744  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  84.43 
 
 
4575 bp  91.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02030    78.97 
 
 
4377 bp  91.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346684  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03190    86.96 
 
 
4905 bp  87.7  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  unclonable  0.000000117128  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01270    80.85 
 
 
2262 bp  87.7  0.00000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.280012  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02050    83.21 
 
 
3573 bp  85.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250754  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00530    77.57 
 
 
4734 bp  85.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0903388  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    83.21 
 
 
7164 bp  85.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    78.62 
 
 
11454 bp  83.8  0.0000000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03670    86.75 
 
 
1830 bp  77.8  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0490526  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01480    82.44 
 
 
12126 bp  77.8  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.363818  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03030    81.34 
 
 
7155 bp  67.9  0.00000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.566664  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00510    91.49 
 
 
3126 bp  61.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0721861  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03630    96.88 
 
 
1917 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664916  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    96.88 
 
 
7809 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02800    96.88 
 
 
5544 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02860    80.47 
 
 
1383 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  96.88 
 
 
4245 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03080    96.88 
 
 
6546 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.589577  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03050    96.88 
 
 
2400 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02970    96.88 
 
 
3063 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.161059  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    96.88 
 
 
9432 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02040    96.77 
 
 
5451 bp  54  0.0005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0657363  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00550    90.24 
 
 
1743 bp  50.1  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
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