51 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA03690 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006687  CNE03000    98.6 
 
 
6462 bp  2539    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00550    98.16 
 
 
1743 bp  884    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    96.73 
 
 
9432 bp  2526    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01990    96.27 
 
 
4092 bp  3211    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02000    98.15 
 
 
5844 bp  3973    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02040    96.68 
 
 
5451 bp  3521    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0657363  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02920    97.97 
 
 
11331 bp  3941    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.355289  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02930    98.23 
 
 
6690 bp  4692    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.248391  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02940    97.6 
 
 
6219 bp  3891    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339763  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02970    98.58 
 
 
3063 bp  4478    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.161059  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02990    97.61 
 
 
4911 bp  896    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000623592  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03620    94.92 
 
 
1755 bp  759    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124458  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03040    98.11 
 
 
6606 bp  3969    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03050    97.58 
 
 
2400 bp  2666    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03080    98.4 
 
 
6546 bp  5999    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.589577  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03090    98.59 
 
 
579 bp  795    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.598355  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03140  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  98.61 
 
 
4787 bp  4052    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03190    96.07 
 
 
4905 bp  1447    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  unclonable  0.000000117128  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    96.2 
 
 
3186 bp  930    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01470    95.97 
 
 
1707 bp  2807    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0419908  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01480    98.01 
 
 
12126 bp  900    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.363818  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    96.11 
 
 
12648 bp  3184    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00530    95.27 
 
 
4734 bp  696    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0903388  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03610    96.62 
 
 
3504 bp  1461    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.370097  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03630    98.94 
 
 
1917 bp  1790    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664916  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    100 
 
 
7809 bp  15480    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03700    95.23 
 
 
3273 bp  1380    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389687  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02780    96.6 
 
 
7383 bp  733    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    96.23 
 
 
11454 bp  835    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02800    99.08 
 
 
5544 bp  3939    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02840    98.29 
 
 
6225 bp  3996    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    97.59 
 
 
10638 bp  5592    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  97.14 
 
 
4245 bp  4054    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00510    95.73 
 
 
3126 bp  751    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0721861  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    94.33 
 
 
7164 bp  3749    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00510    96.37 
 
 
5559 bp  726    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0748048  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01510    91.88 
 
 
1392 bp  617  1e-173  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.83208  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02950    97.53 
 
 
5775 bp  498  1e-137  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0398404  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00490    94.07 
 
 
5811 bp  375  1e-100  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0199944  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02820    100 
 
 
1773 bp  347  2.9999999999999998e-92  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03120    91.39 
 
 
2895 bp  339  7.000000000000001e-90  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03030    90.94 
 
 
7155 bp  327  3e-86  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.566664  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00520    93.75 
 
 
4542 bp  301  2e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285744  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03650    98.4 
 
 
4674 bp  232  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00520    98.33 
 
 
534 bp  222  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0038147  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01460    99.12 
 
 
2397 bp  218  2e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0805614  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02050    96.12 
 
 
3573 bp  172  1.0000000000000001e-39  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250754  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01280    85.51 
 
 
1829 bp  58  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    96.88 
 
 
5637 bp  56  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    96.88 
 
 
5499 bp  56  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03640    96.88 
 
 
6336 bp  56  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
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