30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03040 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA03630    95.29 
 
 
1917 bp  1263    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664916  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01510    92.33 
 
 
1392 bp  1544    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.83208  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    96.67 
 
 
12648 bp  5000    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03190    96.05 
 
 
4905 bp  1691    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  unclonable  0.000000117128  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03140  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  98.62 
 
 
4787 bp  5305    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03080    95.94 
 
 
6546 bp  4625    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.589577  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03040    100 
 
 
6606 bp  13090    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02970    97 
 
 
3063 bp  1451    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.161059  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02940    97.56 
 
 
6219 bp  5081    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.339763  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02930    96.96 
 
 
6690 bp  1606    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.248391  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02920    98.62 
 
 
11331 bp  5305    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.355289  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02040    95.98 
 
 
5451 bp  4837    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0657363  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02000    98.3 
 
 
5844 bp  5224    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01990    96.88 
 
 
4092 bp  5046    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    97.29 
 
 
9432 bp  2151    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    96.43 
 
 
10638 bp  4144    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00520    96.42 
 
 
534 bp  902    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0038147  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    93.83 
 
 
7164 bp  759    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  96.63 
 
 
4245 bp  2900    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00490    96.22 
 
 
5811 bp  1053    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0199944  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02840    98.37 
 
 
6225 bp  5250    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02820    96.36 
 
 
1773 bp  720    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02800    96.22 
 
 
5544 bp  4895    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    95.84 
 
 
11454 bp  1009    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02780    98.72 
 
 
7383 bp  1170    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03700    94.74 
 
 
3273 bp  2385    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.389687  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    98.11 
 
 
7809 bp  3969    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03610    97.36 
 
 
3504 bp  3218    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.370097  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03090    98.14 
 
 
579 bp  593  1e-166  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.598355  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01280    85.51 
 
 
1829 bp  58  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
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