39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNE03000 on replicon NC_006687
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  97.38 
 
 		 4245 bp  2234    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02950    99.75 
 
 		 3657 bp  7178    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.565441  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02930    98.67 
 
 		 6690 bp  2547    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.248391  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02970    99.85 
 
 		 3063 bp  2662    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.161059  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02040    95.8 
 
 		 5451 bp  1649    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0657363  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03000    100 
 
 		 6462 bp  12810    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    96.98 
 
 		 9432 bp  1211    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    99.07 
 
 		 10638 bp  4952    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03050    97.05 
 
 		 2400 bp  1538    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    95.48 
 
 		 3186 bp  898    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    95.95 
 
 		 7164 bp  2254    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01470    96.68 
 
 		 1707 bp  2327    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0419908  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03080    99.04 
 
 		 6546 bp  2587    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.589577  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02820    97.32 
 
 		 1773 bp  1055    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02800    99.41 
 
 		 5544 bp  1968    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    98.74 
 
 		 5637 bp  4339    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    98.38 
 
 		 12648 bp  4809    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    98.6 
 
 		 7809 bp  2539    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    98.8 
 
 		 5499 bp  4896    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03640    99.07 
 
 		 6336 bp  4952    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03280  hypothetical protein  85.96 
 
 		 1307 bp  301  1e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.168835  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03060    79.43 
 
 		 4713 bp  123  6.9999999999999995e-25  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710679  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02030    79.14 
 
 		 4377 bp  115  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346684  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00530    79.14 
 
 		 4734 bp  115  2e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0903388  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02990    85.5 
 
 		 4911 bp  109  1e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000623592  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02950    84.73 
 
 		 5775 bp  101  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0398404  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    77.96 
 
 		 11454 bp  101  2e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01480    78.57 
 
 		 12126 bp  99.6  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.363818  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02050    83.97 
 
 		 3573 bp  93.7  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250754  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03110    80.09 
 
 		 825 bp  91.7  0.000000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.87032  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03190    86.96 
 
 		 4905 bp  87.7  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  unclonable  0.000000117128  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01270    80.85 
 
 		 2262 bp  87.7  0.00000000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.280012  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00520    83.21 
 
 		 4542 bp  85.7  0.0000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285744  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  83.61 
 
 		 4575 bp  83.8  0.0000000000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03670    86.75 
 
 		 1830 bp  77.8  0.00000000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0490526  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03030    82.09 
 
 		 7155 bp  75.8  0.0000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.566664  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02860    81.25 
 
 		 1383 bp  63.9  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00510    91.49 
 
 		 3126 bp  61.9  0.000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0721861  n/a   
 
 
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NC_006679  CNJ02780    88.46 
 
 		 7383 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
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