48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNH01490 on replicon NC_006693
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006691  CNF03090    97.22 
 
 
579 bp  1015    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.598355  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03000    98.38 
 
 
6462 bp  4809    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02970    96.65 
 
 
3063 bp  2874    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.161059  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02950    98.23 
 
 
3657 bp  4777    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.565441  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03190    96.54 
 
 
4905 bp  1727    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  unclonable  0.000000117128  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02930    96.48 
 
 
6690 bp  2948    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.248391  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    96.01 
 
 
3186 bp  918    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02040    96.99 
 
 
5451 bp  7138    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0657363  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03040    96.67 
 
 
6606 bp  4999    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01990    98.08 
 
 
4092 bp  7366    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    98.87 
 
 
9432 bp  2510    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03050    96.61 
 
 
2400 bp  2074    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    98.47 
 
 
10638 bp  9819    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03080    97.18 
 
 
6546 bp  5868    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.589577  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00520    98.31 
 
 
534 bp  981    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0038147  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    95.73 
 
 
7164 bp  2847    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  98.8 
 
 
4245 bp  4230    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01470    97.72 
 
 
1707 bp  2930    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0419908  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00490    96.29 
 
 
5811 bp  1511    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0199944  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    100 
 
 
12648 bp  25070    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02820    96.64 
 
 
1773 bp  1023    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02800    96.6 
 
 
5544 bp  7083    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    95.1 
 
 
11454 bp  1394    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02780    95.98 
 
 
7383 bp  1473    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    96.11 
 
 
7809 bp  3184    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    98.02 
 
 
5499 bp  10040    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    98.64 
 
 
5637 bp  5921    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03640    98.47 
 
 
6336 bp  11400    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03630    97.35 
 
 
1917 bp  1608    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664916  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00550    98.12 
 
 
1743 bp  464  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03280  hypothetical protein  82.79 
 
 
1307 bp  301  3e-78  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.168835  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01460    99.12 
 
 
2397 bp  218  3e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0805614  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03060    78.86 
 
 
4713 bp  107  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710679  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02950    84.73 
 
 
5775 bp  101  5e-18  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0398404  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02030    78.57 
 
 
4377 bp  99.6  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346684  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00530    78.57 
 
 
4734 bp  99.6  2e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0903388  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02050    83.97 
 
 
3573 bp  93.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250754  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI00640  conserved hypothetical protein  82.78 
 
 
4575 bp  93.7  0.000000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.334737  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01270    80.85 
 
 
2262 bp  87.7  0.00000000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.280012  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00520    83.21 
 
 
4542 bp  85.7  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285744  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01480    83.21 
 
 
12126 bp  85.7  0.0000000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.363818  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03110    79.65 
 
 
825 bp  83.8  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.87032  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03030    78 
 
 
7155 bp  83.8  0.000000000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.566664  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03670    86.75 
 
 
1830 bp  77.8  0.00000000007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0490526  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02860    81.25 
 
 
1383 bp  63.9  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00510    91.49 
 
 
3126 bp  61.9  0.000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0721861  n/a   
 
 
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NC_006670  CNA03620    100 
 
 
1755 bp  58  0.00007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.124458  n/a   
 
 
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NC_006691  CNF03120    100 
 
 
2895 bp  56  0.0003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
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