30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03080 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Replicon accession

Locus tag

Product

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Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA03630    98.23 
 
 
1917 bp  2087    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664916  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    95.66 
 
 
3186 bp  906    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03190    97.33 
 
 
4905 bp  1794    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  unclonable  0.000000117128  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01470    96.33 
 
 
1707 bp  2855    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0419908  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03090    98.1 
 
 
579 bp  1061    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.598355  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03080    100 
 
 
6546 bp  12980    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.589577  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03050    98.59 
 
 
2400 bp  2785    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03040    95.94 
 
 
6606 bp  4625    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03000    99.04 
 
 
6462 bp  2587    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02970    98.66 
 
 
3063 bp  5741    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.161059  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02930    98.19 
 
 
6690 bp  5079    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.248391  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02040    97.6 
 
 
5451 bp  8358    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0657363  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01990    97.23 
 
 
4092 bp  5658    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    96.66 
 
 
9432 bp  2518    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    98.03 
 
 
10638 bp  9850    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00520    97.74 
 
 
534 bp  957    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0038147  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    94.66 
 
 
7164 bp  3818    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  97.49 
 
 
4245 bp  6825    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00490    96.17 
 
 
5811 bp  1562    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0199944  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02820    99.08 
 
 
1773 bp  827    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02800    98.53 
 
 
5544 bp  8722    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    98.28 
 
 
11454 bp  1699    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02780    96.79 
 
 
7383 bp  1580    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    98.4 
 
 
7809 bp  5999    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    97.18 
 
 
12648 bp  5868    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01460    98.25 
 
 
2397 bp  210  4e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0805614  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01280    85.51 
 
 
1829 bp  58  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    96.88 
 
 
5637 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    96.88 
 
 
5499 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03640    96.88 
 
 
6336 bp  56  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
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