18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNM00520 on replicon NC_006682
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

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Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006679  CNJ02800    96.8 
 
 
5544 bp  918    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    98.31 
 
 
12648 bp  981    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  97.74 
 
 
4245 bp  957    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00520    100 
 
 
534 bp  1059    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0038147  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    96.99 
 
 
10638 bp  926    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    97.36 
 
 
9432 bp  942    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01990    97.93 
 
 
4092 bp  965    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02040    98.12 
 
 
5451 bp  973    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0657363  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02930    96.88 
 
 
6690 bp  666    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.248391  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03080    97.74 
 
 
6546 bp  957    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.589577  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02970    98.49 
 
 
3063 bp  989    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.161059  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03040    96.42 
 
 
6606 bp  902    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03630    97.7 
 
 
1917 bp  549  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664916  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03090    97.08 
 
 
579 bp  480  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.598355  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    98.33 
 
 
7809 bp  222  7.999999999999999e-56  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02940    96.3 
 
 
4674 bp  46.1  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0953543  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02010    96.3 
 
 
3753 bp  46.1  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.788594  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00500    96.3 
 
 
1650 bp  46.1  0.01  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
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