20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNF03090 on replicon NC_006691
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



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Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006670  CNA03690    98.59 
 
 
7809 bp  795    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    97.22 
 
 
12648 bp  1015    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03090    100 
 
 
579 bp  1148    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.598355  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03080    98.1 
 
 
6546 bp  1061    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.589577  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02970    97.93 
 
 
3063 bp  1053    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.161059  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02930    98.27 
 
 
6690 bp  1068    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.248391  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02040    97.41 
 
 
5451 bp  1029    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0657363  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01990    97.57 
 
 
4092 bp  1031    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    97.22 
 
 
9432 bp  759    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    98.27 
 
 
10638 bp  1068    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  96.88 
 
 
4245 bp  999    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02800    97.93 
 
 
5544 bp  1053    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03630    97.41 
 
 
1917 bp  1029    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664916  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03040    98.14 
 
 
6606 bp  593  1e-167  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00520    97.08 
 
 
534 bp  480  1e-133  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.0038147  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01460    99.12 
 
 
2397 bp  218  9.999999999999999e-55  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0805614  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02010    100 
 
 
3753 bp  54  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.788594  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02940    100 
 
 
4674 bp  54  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0953543  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00500    100 
 
 
1650 bp  54  0.00005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02780    85.96 
 
 
7383 bp  50.1  0.0007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
-
 
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