46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNL04180 on replicon NC_006681
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006691  CNF03050    95.7 
 
 		 2400 bp  2444    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02030    97.16 
 
 		 4377 bp  5376    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.346684  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02040    94.89 
 
 		 5451 bp  2595    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0657363  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03630    94.5 
 
 		 1917 bp  842    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.664916  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02930    95.15 
 
 		 6690 bp  3426    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.248391  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB02950    94.63 
 
 		 5775 bp  5233    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0398404  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02970    95.39 
 
 		 3063 bp  3223    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.161059  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02990    92.24 
 
 		 4911 bp  3473    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.000623592  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03000    95.95 
 
 		 6462 bp  2254    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00372907  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03030    84.36 
 
 		 7155 bp  1082    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.566664  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03040    93.83 
 
 		 6606 bp  759    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN02050    93.93 
 
 		 3573 bp  4890    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.250754  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03060    97.02 
 
 		 4713 bp  5333    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710679  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03080    94.66 
 
 		 6546 bp  3818    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.589577  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03110    87.7 
 
 		 825 bp  803    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.87032  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03190    94.77 
 
 		 4905 bp  797    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  unclonable  0.000000117128  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01450    95.65 
 
 		 3186 bp  904    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01470    95.37 
 
 		 1707 bp  2722    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0419908  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01480    94.59 
 
 		 12126 bp  4734    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.363818  n/a   
 
 
-
 
NC_006693  CNH01490    95.73 
 
 		 12648 bp  2847    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01290    97.67 
 
 		 2966 bp  920    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00560    95.67 
 
 		 9432 bp  2192    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03650    95.08 
 
 		 4674 bp  2555    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03670    97.65 
 
 		 1830 bp  3287    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0490526  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03690    94.33 
 
 		 7809 bp  3749    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.858163  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02780    94.73 
 
 		 7383 bp  718    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0276994  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02790    96.84 
 
 		 11454 bp  4320    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02800    94.98 
 
 		 5544 bp  2617    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02820    95.19 
 
 		 1773 bp  1001    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00490    95.75 
 
 		 5811 bp  821    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0199944  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK00520    95.47 
 
 		 4542 bp  4155    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0285744  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04160  retrotransposon nucleocapsid protein, putative  94.95 
 
 		 4245 bp  3009    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0468988  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04180    100 
 
 		 7164 bp  14200    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.192446  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00510    93.05 
 
 		 3126 bp  1463    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0721861  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00530    97.34 
 
 		 4734 bp  4387    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0903388  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00540    94.66 
 
 		 10638 bp  3816    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.271423  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00550    99.64 
 
 		 1743 bp  1094    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01990    95.55 
 
 		 4092 bp  835    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02860    83.76 
 
 		 1383 bp  547  9.999999999999999e-153  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02530  hypothetical protein  82.06 
 
 		 1581 bp  147  4.999999999999999e-32  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.857331  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI01280    98.55 
 
 		 1829 bp  129  9.999999999999999e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02950    78.89 
 
 		 3657 bp  105  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.565441  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03680    78.89 
 
 		 5499 bp  105  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA03640    78.89 
 
 		 6336 bp  105  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03100    83.21 
 
 		 5637 bp  85.7  0.0000000000002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.764766  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE02930    100 
 
 		 5061 bp  50.1  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108967  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>