35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND03750 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006686  CND03750  GrfA protein, putative  100 
 
 
1314 aa  2703    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01370  expressed protein  30.56 
 
 
435 aa  196  2e-48  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01680  hypothetical protein  26.59 
 
 
495 aa  135  5e-30  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03630  protein binding protein, putative  30.59 
 
 
1978 aa  59.7  0.0000004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.326559  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09188  putative outermembrane protein  40.7 
 
 
307 aa  57.4  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.885938  n/a   
 
 
-
 
NC_006684  CNB04070  conserved hypothetical protein  30.61 
 
 
1281 aa  54.3  0.00001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_009974  Haur_5261  leucine-rich repeat-containing protein  30.13 
 
 
558 aa  52  0.00007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10442  Rho guanyl nucleotide exchange factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G04600)  21.79 
 
 
1921 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04435  cell morphogenesis protein Sog2, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07260)  32.53 
 
 
980 aa  51.2  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4612  hypothetical protein  28.29 
 
 
416 aa  50.4  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.19236 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03602  Glucose-repressible alcohol dehydrogenase transcriptional effector (EC 3.1.13.4)(Carbon catabolite repressor protein 4)(Cytoplasmic deadenylase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5B778]  36.25 
 
 
675 aa  49.7  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7693  Phosphoprotein phosphatase  38.55 
 
 
1263 aa  49.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2359  leucine-rich repeat-containing protein  26.81 
 
 
296 aa  49.7  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.260952  normal  0.0814823 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4016  hypothetical protein  39.74 
 
 
447 aa  48.9  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3413  serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 
447 aa  47.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.287341 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3035  leucine-rich protein  36.78 
 
 
291 aa  46.6  0.003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0118169  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0539  serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 
447 aa  47  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.652684 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3256  protein kinase  37.18 
 
 
446 aa  47  0.003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0626  protein kinase  37.18 
 
 
451 aa  47  0.003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1652  protein kinase  35.87 
 
 
490 aa  46.2  0.004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0364974  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0991  hypothetical protein  43.21 
 
 
354 aa  46.2  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3344  hypothetical protein  36.26 
 
 
892 aa  46.2  0.004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.952611  hitchhiker  0.00915052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0653  protein kinase  37.18 
 
 
451 aa  46.2  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4737  serine/threonine protein kinase  34.57 
 
 
436 aa  46.2  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2066  leucine-rich repeat protein  38.55 
 
 
508 aa  46.2  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5707  leucine-rich repeat protein  32 
 
 
802 aa  46.2  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0557  Serine/threonine protein kinase  37.04 
 
 
445 aa  45.8  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0649  serine/threonine protein kinase  37.18 
 
 
451 aa  45.4  0.006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07783  Rho guanyl nucleotide exchange factor, putative (AFU_orthologue; AFUA_5G07430)  22.14 
 
 
1788 aa  45.4  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.313373  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2057  leucine-rich repeat protein  35.96 
 
 
482 aa  45.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723392  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3736  protein kinase  37.18 
 
 
451 aa  45.1  0.01  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4987  serine/threonine protein kinase  34.41 
 
 
437 aa  45.1  0.01  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.815598  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3380  serine/threonine protein kinase  34.41 
 
 
437 aa  45.1  0.01  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.367519  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1493  small GTP-binding protein domain-containing protein  31.03 
 
 
1107 aa  45.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07005  conserved leucine-rich repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_4G04440)  37.5 
 
 
972 aa  45.1  0.01  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>