87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_0682 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0682  ComEA protein  100 
 
 		 92 aa  183  7e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0047  hypothetical protein  60.34 
 
 		 104 aa  79.3  0.00000000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0993  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35 
 
 		 90 aa  56.2  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0367342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3100  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.71 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2698  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.71 
 
 		 135 aa  54.3  0.0000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.48092  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0339  hypothetical protein  36.05 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00775538  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2222  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  41.98 
 
 		 100 aa  50.4  0.000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1714  DNA transport competence protein  41.1 
 
 		 109 aa  50.4  0.000009  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0133378  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20070  ComEA-related protein  42.86 
 
 		 110 aa  50.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1766  competence protein ComEA  41.46 
 
 		 89 aa  49.3  0.00002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0368807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1392  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.19 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0637588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1470  hypothetical protein  29.17 
 
 		 732 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00224315  normal  0.752366 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1984  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.54 
 
 		 107 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0142259  normal  0.337896 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0922  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  36.96 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.425592 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1066  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  36.96 
 
 		 99 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01422  hypothetical protein  39.71 
 
 		 95 aa  47.4  0.00006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1548  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.71 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.157658  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1879  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.54 
 
 		 107 aa  47.4  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.382969  normal  0.520774 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02250  DNA transport competence protein  38.81 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1644  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40.28 
 
 		 109 aa  47  0.00008  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.374375  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0230  acetohydroxy acid synthase large subunit  40.62 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0624  hypothetical protein  40.62 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2552  helix-hairpin-helix motif protein  43.55 
 
 		 298 aa  47  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1407  hypothetical protein  40.62 
 
 		 115 aa  47  0.00008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0011  competence protein ComEA  43.08 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00025095  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0037  competence protein ComEA  43.08 
 
 		 79 aa  47  0.00009  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0368973  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0010  competence protein ComEA  41.54 
 
 		 79 aa  46.2  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0510  hypothetical protein  34.57 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0596  hypothetical protein  34.57 
 
 		 134 aa  46.2  0.0001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.368264  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1415  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.1 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0694411 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3003  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.94 
 
 		 91 aa  45.8  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.347216  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2489  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  44.23 
 
 		 99 aa  46.2  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.632838  normal  0.0131987 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5471  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  37.7 
 
 		 225 aa  45.8  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0113  putative competence DNA binding protein ComEA  42.62 
 
 		 115 aa  45.4  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.203684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2087  comE operon protein 1, putative  44.26 
 
 		 254 aa  46.2  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0466  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  33.33 
 
 		 265 aa  45.8  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2375  putative comE operon protein 1  44.26 
 
 		 254 aa  45.8  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2071  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.99 
 
 		 190 aa  45.1  0.0003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1987  hypothetical protein  38.71 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.827734  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1813  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.06 
 
 		 112 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3898  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  39.06 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.209502 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0740  DNA uptake/competence protein  40 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4977199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0398  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  35.94 
 
 		 136 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0049521  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0979  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  34.25 
 
 		 108 aa  44.7  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.160032  normal  0.0718361 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  41.07 
 
 		 107 aa  44.3  0.0006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216127  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23480  hypothetical protein  38.71 
 
 		 109 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00152182  hitchhiker  0.00697209 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2137  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  35.53 
 
 		 100 aa  44.3  0.0006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4041  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  42.19 
 
 		 111 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.203214  normal  0.860547 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40 
 
 		 187 aa  43.9  0.0008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0462  ComE operon protein 1  37.31 
 
 		 83 aa  43.9  0.0008  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1953  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.1 
 
 		 238 aa  43.9  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00139923  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2082  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  33.85 
 
 		 169 aa  43.9  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.918222  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2662  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.62 
 
 		 105 aa  43.9  0.0008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2120  copper amine oxidase domain protein  36.84 
 
 		 502 aa  43.9  0.0008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1428  hypothetical protein  37.78 
 
 		 173 aa  43.1  0.001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0277  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40.32 
 
 		 126 aa  43.5  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0216595  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2033  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  32.95 
 
 		 93 aa  42.7  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000281796  hitchhiker  0.000016405 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.07 
 
 		 227 aa  43.5  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4460  comE operon protein 1  36.07 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000156919  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0767  competence protein ComE, putative  41.94 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4349  comE operon protein 1  36.07 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000484477 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4408  comE operon protein 1  36.07 
 
 		 198 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0122  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  42.86 
 
 		 143 aa  42.7  0.002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.214821  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4074  comE operon protein 1  36.07 
 
 		 199 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1142  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat-containing protein  37.7 
 
 		 315 aa  41.6  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.702524  normal  0.935531 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004039  DNA uptake protein  36.76 
 
 		 97 aa  42  0.003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000258752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4226  comE operon protein 1  36.07 
 
 		 199 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4064  comE operon protein 1  36.07 
 
 		 199 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0884227  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1944  DNA uptake protein related DNA-binding protein  42.62 
 
 		 200 aa  41.6  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.727384  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2156  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  32.79 
 
 		 90 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.367346  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2451  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  37.29 
 
 		 204 aa  41.6  0.003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1771  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  37.5 
 
 		 99 aa  41.6  0.003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.219727  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4553  ComE operon protein 1  36.07 
 
 		 198 aa  41.6  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0361747  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3612  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  30 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.393619  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  32.2 
 
 		 545 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06940  glycogen/starch synthase, ADP-glucose type  40 
 
 		 587 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.1185  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3461  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  30 
 
 		 111 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.111662  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  32.2 
 
 		 545 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3544  helix-hairpin-helix DNA-binding, class 1  30 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1008  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  39.39 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000463906  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3888  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  32.5 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0912284  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1561  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  40.32 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.230085  hitchhiker  0.0000735026 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0643  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35.82 
 
 		 210 aa  40.8  0.007  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000019703  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1174  hypothetical protein  31.88 
 
 		 658 aa  40.8  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3571  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.57 
 
 		 109 aa  40.4  0.008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.319885  normal  0.0118873 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2007  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  37.1 
 
 		 585 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1507  hypothetical protein  42.11 
 
 		 103 aa  40  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.24688e-16  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>