87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCC13826_0047 on replicon NC_009802
Organism: Campylobacter concisus 13826



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0047  hypothetical protein  100 
 
 		 104 aa  197  3e-50  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0682  ComEA protein  55 
 
 		 92 aa  84.3  5e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0462  ComE operon protein 1  47.69 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1407  hypothetical protein  53.45 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0624  hypothetical protein  53.45 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0230  acetohydroxy acid synthase large subunit  53.45 
 
 		 115 aa  58.9  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1699  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.67 
 
 		 181 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1428  hypothetical protein  47.46 
 
 		 173 aa  54.7  0.0000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.122979  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0011  competence protein ComEA  40 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00025095  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0037  competence protein ComEA  40 
 
 		 79 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0368973  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0596  hypothetical protein  39.33 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.368264  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0510  hypothetical protein  39.33 
 
 		 134 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.641204  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0010  competence protein ComEA  38.67 
 
 		 79 aa  53.9  0.0000007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1756  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.33 
 
 		 181 aa  53.5  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2082  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  47.46 
 
 		 169 aa  52.8  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.918222  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0339  hypothetical protein  37.65 
 
 		 83 aa  49.3  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00775538  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3083  helix-hairpin-helix motif protein  42.19 
 
 		 543 aa  48.5  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.332524 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0069  ComE operon protein 1  42.59 
 
 		 54 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5823  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  40 
 
 		 158 aa  47.8  0.00005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2375  putative comE operon protein 1  40.98 
 
 		 254 aa  47.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1704  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.98 
 
 		 227 aa  47.4  0.00006  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1766  competence protein ComEA  39.24 
 
 		 89 aa  47.4  0.00006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0368807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2489  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  51.06 
 
 		 99 aa  47.4  0.00006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.632838  normal  0.0131987 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2662  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  42.37 
 
 		 105 aa  47.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.648617  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2087  comE operon protein 1, putative  40.98 
 
 		 254 aa  47.4  0.00008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2222  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  36.76 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3100  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  27.66 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2698  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  27.66 
 
 		 135 aa  46.6  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.48092  hitchhiker  0.00000193107 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3003  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35.29 
 
 		 91 aa  46.6  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.347216  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2033  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  32.05 
 
 		 93 aa  46.2  0.0002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  unclonable  0.00000000000281796  hitchhiker  0.000016405 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0934  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  48.89 
 
 		 211 aa  45.4  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.800656  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2122  RNA-binding S1 domain-containing protein  33.33 
 
 		 849 aa  45.8  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00161735  normal  0.0955174 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0466  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  31.11 
 
 		 265 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1008  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  38.46 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000463906  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20070  ComEA-related protein  38.71 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1484  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  39.29 
 
 		 194 aa  44.3  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1984  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.94 
 
 		 107 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0142259  normal  0.337896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2273  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  36.67 
 
 		 259 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1879  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  41.27 
 
 		 107 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.382969  normal  0.520774 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2137  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  31.87 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2451  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.98 
 
 		 204 aa  43.1  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0119288  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2830  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  37.29 
 
 		 230 aa  43.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.192028  normal  0.919156 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1589  DNA uptake protein related DNA-binding protein  40 
 
 		 211 aa  42.7  0.002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.821877  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1714  DNA transport competence protein  32.58 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0133378  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1644  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  32.58 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.374375  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0773  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  33.33 
 
 		 250 aa  42.4  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.466163  normal  0.364804 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1757  competence protein, putative  44.44 
 
 		 109 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.610163  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3635  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  41.27 
 
 		 120 aa  42.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.37256 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0398  DNA uptake protein and related DNA-binding protein-like protein  36.07 
 
 		 136 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0049521  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0113  putative competence DNA binding protein ComEA  37.1 
 
 		 115 aa  41.6  0.003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.203684  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00510  RNA binding S1 domain protein  48.98 
 
 		 722 aa  41.6  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  0.000000000000209068  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1635  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  32.79 
 
 		 228 aa  42  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1668  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.18 
 
 		 206 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_12590  DNA uptake protein  32.84 
 
 		 352 aa  41.6  0.004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0407  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  46.81 
 
 		 131 aa  41.6  0.004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000244274  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2662  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.33 
 
 		 263 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0963672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4349  comE operon protein 1  33.9 
 
 		 198 aa  41.2  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000484477 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  36.67 
 
 		 107 aa  41.6  0.004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.216127  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3228  helix-hairpin-helix motif protein  36.21 
 
 		 545 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.269914 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10240  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  36.67 
 
 		 243 aa  41.2  0.005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.773806  hitchhiker  0.000000381007 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3520  competence protein ComEA helix-hairpin-helix region  33.9 
 
 		 267 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2868  helix-hairpin-helix motif protein  36.21 
 
 		 545 aa  41.2  0.005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0740  DNA uptake/competence protein  35.09 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  5.4977199999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3525  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.9 
 
 		 267 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367673  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3915  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  35 
 
 		 269 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.261792  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1886  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.1 
 
 		 300 aa  41.2  0.005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.528332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3593  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  33.9 
 
 		 267 aa  41.2  0.005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.663406 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0558  Fis family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 99 aa  40.8  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.340752  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4226  comE operon protein 1  33.9 
 
 		 199 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4064  comE operon protein 1  33.9 
 
 		 199 aa  40.4  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0884227  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4460  comE operon protein 1  33.9 
 
 		 198 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000156919  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1682  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.7 
 
 		 225 aa  40.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00173147  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1000  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  38.33 
 
 		 207 aa  40.8  0.007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1647  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  37.7 
 
 		 225 aa  40.4  0.007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4553  ComE operon protein 1  33.9 
 
 		 198 aa  40.4  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0361747  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17420  competence protein ComEA-like protein with helix-hairpin-helix repeat region  38.46 
 
 		 279 aa  40.8  0.007  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.711078  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1103  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.67 
 
 		 187 aa  40.4  0.007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000407291  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4447  comE operon protein 1  33.9 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00373204  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4074  comE operon protein 1  33.9 
 
 		 199 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4408  comE operon protein 1  33.9 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0790  comE operon protein 1  33.9 
 
 		 198 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0708257  hitchhiker  0.000000131461 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3304  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  36.67 
 
 		 214 aa  40.4  0.009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0506678  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0643  helix-hairpin-helix repeat-containing competence protein ComEA  36.67 
 
 		 210 aa  40.4  0.009  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000019703  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1257  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  37.7 
 
 		 219 aa  40.4  0.009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000000791854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3189  competence protein ComEA helix-hairpin-helix repeat protein  33.9 
 
 		 286 aa  40  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1243  DNA uptake protein-related DNA-binding protein  40.43 
 
 		 103 aa  40  0.01  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000104956 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0962  DNA uptake protein or related DNA-binding protein  34.43 
 
 		 109 aa  40  0.01  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>