More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmur_2064 on replicon NC_014150
Organism: Brachyspira murdochii DSM 12563



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014150  Bmur_2064  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  100 
 
 
224 aa  452  1.0000000000000001e-126  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000293764  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1057  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.27 
 
 
226 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1245  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.27 
 
 
226 aa  180  1e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0325404  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2959  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.34 
 
 
226 aa  180  2e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2642  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  44.34 
 
 
226 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1507  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.34 
 
 
220 aa  177  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000000296361  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1420  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.34 
 
 
222 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00485508  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4248  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.1 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4209  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.1 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4047  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  41.55 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3885  L-serine dehydratase subunit beta  41.1 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3893  L-serine dehydratase, beta subunit  41.1 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4162  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.1 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4361  l-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  41.55 
 
 
219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0988  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.55 
 
 
220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4272  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.1 
 
 
220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0887  L-serine ammonia-lyase  45.6 
 
 
223 aa  172  3.9999999999999995e-42  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0556305  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1332  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  43.78 
 
 
221 aa  171  6.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.385667  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0097  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.36 
 
 
220 aa  170  1e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000599373  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16340  L-serine ammonia-lyase, beta subunit  44.75 
 
 
218 aa  171  1e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000548669  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3971  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.55 
 
 
220 aa  170  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2835  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  41.55 
 
 
220 aa  170  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2145  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  42.47 
 
 
222 aa  169  4e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1460  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  39.09 
 
 
222 aa  167  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000717015  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1947  L-serine ammonia-lyase  41.55 
 
 
218 aa  167  2e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.376252  hitchhiker  0.000000222078 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0266  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40.18 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0503  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  38.65 
 
 
549 aa  159  3e-38  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.742023 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1760  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  38.74 
 
 
229 aa  156  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.178826  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1282  L-serine dehydratase beta subunit  41.4 
 
 
223 aa  157  2e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.38968  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3836  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  45.36 
 
 
223 aa  156  3e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0141316  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16320  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  39.35 
 
 
552 aa  155  6e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.280056  hitchhiker  0.00195001 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1475  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  46.78 
 
 
220 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0336  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  34.68 
 
 
216 aa  148  6e-35  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.866527  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0199  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  37.73 
 
 
216 aa  148  7e-35  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000000476395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1965  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40.58 
 
 
220 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2853  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  37.02 
 
 
221 aa  145  5e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0221158 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1075  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  38.79 
 
 
220 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.102707  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1252  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  35.85 
 
 
221 aa  142  6e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.809325  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0952  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit  40.86 
 
 
536 aa  141  9.999999999999999e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000235834 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10070  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, alpha subunit/L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  37.22 
 
 
541 aa  134  9.999999999999999e-31  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.000332749  hitchhiker  0.0000000458611 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1074  L-serine ammonia-lyase  40.27 
 
 
220 aa  120  1.9999999999999998e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000107918  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5571  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  33.63 
 
 
232 aa  115  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal  0.244703 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2482  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40.91 
 
 
232 aa  115  6.9999999999999995e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3068  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  40.26 
 
 
232 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.65769  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3288  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  40.26 
 
 
232 aa  113  3e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3308  l-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent subunit beta  40.26 
 
 
232 aa  113  3e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.826727  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2555  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  35.55 
 
 
226 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2607  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  35.55 
 
 
226 aa  103  2e-21  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2095  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, beta subunit  46.79 
 
 
227 aa  100  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1548  serine dehydratase alpha chain  37.5 
 
 
519 aa  90.9  1e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.00000153411  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1902  L-serine dehydratase  34.52 
 
 
455 aa  68.9  0.00000000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.457679  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0288  L-serine ammonia-lyase  34.52 
 
 
455 aa  68.9  0.00000000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0297  L-serine dehydratase, iron-sulfur-dependent, single chain form  34.87 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246036 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0317  L-serine dehydratase 1  34.87 
 
 
458 aa  67.4  0.0000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0491818 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0485  L-serine ammonia-lyase  32.57 
 
 
461 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0322  L-serine dehydratase 1  34.87 
 
 
458 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3503  L-serine dehydratase 1  32 
 
 
461 aa  66.6  0.0000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0527  L-serine dehydratase 1  32.39 
 
 
459 aa  66.2  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33270  L-serine ammonia-lyase  29.69 
 
 
506 aa  65.9  0.0000000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4911  L-serine dehydratase 1  34.21 
 
 
458 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0049698 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5237  L-serine ammonia-lyase  34.21 
 
 
458 aa  65.9  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0233321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5070  L-serine dehydratase 1  31.43 
 
 
461 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4547  L-serine dehydratase 1  31.43 
 
 
461 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5127  L-serine dehydratase 1  30.86 
 
 
461 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5152  L-serine dehydratase 1  30.86 
 
 
461 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4831  L-serine ammonia-lyase  29.27 
 
 
462 aa  63.5  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3321  L-serine ammonia-lyase  33.77 
 
 
462 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0995  L-serine ammonia-lyase  32 
 
 
490 aa  63.5  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3251  L-serine ammonia-lyase  33.11 
 
 
462 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3215  L-serine dehydratase 1  30.86 
 
 
529 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3256  L-serine dehydratase 1  45.45 
 
 
456 aa  63.5  0.000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0396  L-serine ammonia-lyase  32.57 
 
 
545 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2913  L-serine dehydratase 1  32.45 
 
 
462 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0141  L-serine dehydratase 1  32.45 
 
 
462 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0129  L-serine dehydratase 1  32.45 
 
 
462 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1955  L-serine ammonia-lyase  32.57 
 
 
504 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1863  L-serine ammonia-lyase  32.57 
 
 
504 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0142  L-serine dehydratase 1  32.45 
 
 
462 aa  63.2  0.000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3225  L-serine dehydratase 1  34.57 
 
 
475 aa  63.2  0.000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.319975 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3334  L-serine dehydratase 1  32 
 
 
462 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.503028 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0329  L-serine dehydratase 1  34.36 
 
 
463 aa  62  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0045  L-serine dehydratase  33.14 
 
 
461 aa  61.6  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.388959 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2991  L-serine ammonia-lyase  32.45 
 
 
462 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0131  L-serine ammonia-lyase  32.45 
 
 
462 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0920  L-serine ammonia-lyase  32.67 
 
 
458 aa  60.8  0.00000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4002  L-serine ammonia-lyase  32.45 
 
 
462 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3931  L-serine ammonia-lyase  32.45 
 
 
462 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.706313  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3314  L-serine ammonia-lyase  32.45 
 
 
462 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.544154  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3056  L-serine ammonia-lyase  32.45 
 
 
462 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.541658  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1546  L-serine ammonia-lyase  32.45 
 
 
462 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0155  L-serine dehydratase 1  32.45 
 
 
462 aa  60.5  0.00000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4369  L-serine ammonia-lyase  30.73 
 
 
464 aa  60.5  0.00000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0215032  normal  0.503505 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1601  L-serine ammonia-lyase  32.02 
 
 
464 aa  60.1  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71060  L-serine dehydratase  32.89 
 
 
458 aa  60.8  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6165  L-serine dehydratase  32.89 
 
 
485 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.137181  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5047  L-serine dehydratase 1  31.46 
 
 
464 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.533739  normal  0.269496 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3015  L-serine dehydratase 1  34.64 
 
 
462 aa  59.3  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0139  L-serine dehydratase 1  33.33 
 
 
462 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1429  L-serine ammonia-lyase  33.54 
 
 
463 aa  58.5  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3333  L-serine ammonia-lyase  34.42 
 
 
458 aa  58.5  0.00000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>