23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BcerKBAB4_5745 on replicon NC_010180
Organism: Bacillus weihenstephanensis KBAB4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011725  BCB4264_A3587  transcriptional regulator, XRE family, putative  89.65 
 
 		 434 aa  832    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5745  replicative DNA helicase  100 
 
 		 454 aa  944    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0288  replicative DNA helicase  30.19 
 
 		 1272 aa  171  3e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00145922  normal  0.0196343 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1917  DNA polymerase III, alpha subunit  23.96 
 
 		 1607 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0425764  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4333  replicative DNA helicase  25.34 
 
 		 903 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00796105  normal  0.47145 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1889  DNA polymerase III, alpha subunit / intein  23.9 
 
 		 2684 aa  114  5e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2037  DnaB-like protein helicase  24.42 
 
 		 849 aa  113  6e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10057  replicative DNA helicase  24.48 
 
 		 874 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.66357e-17  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0653  DnaB domain-containing protein  29.78 
 
 		 1098 aa  106  7e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0587  XRE family transcriptional regulator  23.11 
 
 		 1381 aa  98.2  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0434088  hitchhiker  0.00000000000000216733 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0015  replicative DNA helicase  23.33 
 
 		 945 aa  94  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.756014  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5064  replicative DNA helicase  23.37 
 
 		 844 aa  92.4  2e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000360056 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2587  replicative DNA helicase  22.95 
 
 		 879 aa  92  2e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00388825  normal  0.462592 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3688  replicative DNA helicase  22.25 
 
 		 1118 aa  89  1e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12750  DNA recombination protein RecA  22.92 
 
 		 790 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  decreased coverage  0.0000250397  normal  0.0414269 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1462  primary replicative DNA helicase  25.2 
 
 		 2605 aa  72.4  0.00000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.695864 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0803  DNA recombination protein RecA precursor  21.29 
 
 		 1177 aa  67  0.0000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106303  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1543  protein splicing site  24.48 
 
 		 1531 aa  57.4  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.706415 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0059  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  23.74 
 
 		 1416 aa  56.2  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.684931  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0442  ribonucleoside-diphosphate reductase, adenosylcobalamin-dependent  23.31 
 
 		 955 aa  50.8  0.00005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2896  replicative DNA helicase  45.1 
 
 		 602 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0132552  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2285  DNA polymerase I  20.62 
 
 		 1273 aa  45.4  0.002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.153285  hitchhiker  0.0000116157 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1141  DNA polymerase II large subunit  26.71 
 
 		 1665 aa  45.1  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>