146 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_6823 on replicon NC_008545
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008545  Bcen2424_6823  thiol:disulfide interchange protein DsbD  100 
 
 		 160 aa  322  1e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.408031  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2810  protein-disulfide reductase  45.69 
 
 		 618 aa  105  4e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.126387  normal  0.451155 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0343  protein-disulfide reductase  43.33 
 
 		 631 aa  99.8  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0138358 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3615  Protein-disulfide reductase  42.19 
 
 		 626 aa  99.8  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0573017  hitchhiker  0.0000000193428 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3717  thiol:disulfide interchange protein, putative  43.28 
 
 		 627 aa  99.4  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3775  thiol:disulfide interchange protein, putative  42.66 
 
 		 627 aa  99.8  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0278  protein-disulfide reductase  42 
 
 		 614 aa  99.4  2e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.108061 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2602  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  43.28 
 
 		 627 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3747  thiol:disulfide interchange protein DsbD  43.28 
 
 		 627 aa  98.6  3e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.14193  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3039  thiol:disulfide interchange protein DsbD, putative  43.28 
 
 		 627 aa  99  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3140  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  43.28 
 
 		 627 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1953  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  43.28 
 
 		 627 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.684775  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3507  putative thiol:disulfide interchange protein DsbD  43.28 
 
 		 627 aa  98.6  3e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.456139  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3476  protein-disulfide reductase  41.94 
 
 		 617 aa  95.9  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.842688 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1312  Protein-disulfide reductase  39.04 
 
 		 625 aa  96.3  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0091784  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1792  Protein-disulfide reductase  40.91 
 
 		 645 aa  94.7  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.611458 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2730  protein-disulfide reductase  39.74 
 
 		 615 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0377  protein-disulfide reductase  39.74 
 
 		 615 aa  94  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0356  protein-disulfide reductase  40.69 
 
 		 615 aa  92  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.456746 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0296  protein-disulfide reductase  41.38 
 
 		 611 aa  90.9  6e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.58017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2773  Protein-disulfide reductase  40.17 
 
 		 632 aa  90.9  7e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1683  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.8 
 
 		 624 aa  89  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.424941  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3288  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  37.5 
 
 		 624 aa  89  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5366  Protein-disulfide reductase  41.41 
 
 		 648 aa  89  3e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3151  protein-disulfide reductase  36.43 
 
 		 639 aa  86.3  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2921  Protein-disulfide reductase  40.87 
 
 		 604 aa  85.9  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000351714 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2990  thiol:disulfide interchange transmembrane protein  40.5 
 
 		 608 aa  85.1  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0305  protein-disulfide reductase  40.65 
 
 		 611 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.069977 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3268  Protein-disulfide reductase  43.97 
 
 		 605 aa  84  9e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0181869 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1568  protein-disulfide reductase  34.65 
 
 		 622 aa  81.6  0.000000000000004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.314287  normal  0.0195641 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3415  disulfide reductase  41.44 
 
 		 623 aa  81.3  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.189847 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2010  protein-disulfide reductase  39.2 
 
 		 649 aa  76.3  0.0000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0231364 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0520  protein-disulfide reductase  33.33 
 
 		 610 aa  73.2  0.000000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00644414  normal  0.263509 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1181  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.62 
 
 		 628 aa  73.2  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.753424  normal  0.0698623 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2592  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  36.84 
 
 		 654 aa  72.4  0.000000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_64080  thiol:disulfide interchange protein precursor  38.14 
 
 		 591 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0669  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  37.07 
 
 		 810 aa  71.6  0.000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4167  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  38.02 
 
 		 586 aa  70.5  0.00000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0621  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.7 
 
 		 585 aa  68.2  0.00000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.46991  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1041  DsbD family thiol:disulfide interchange protein  36.89 
 
 		 745 aa  67.8  0.00000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5565  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.52 
 
 		 591 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0545  thiol:disulfide interchange protein DsbD  36.09 
 
 		 616 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.221768  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0701  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  36.09 
 
 		 616 aa  67  0.00000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0529075  hitchhiker  0.000000140832 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0472  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  34.4 
 
 		 605 aa  65.1  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.566049  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3681  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.04 
 
 		 595 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.576987  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0728  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.04 
 
 		 595 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3828  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.04 
 
 		 595 aa  65.5  0.0000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.368823  n/a   
 
 
-
 
NC_010070  Bmul_6280  protein-disulfide reductase  33.78 
 
 		 623 aa  65.1  0.0000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.432431 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4665  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.54 
 
 		 565 aa  64.3  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.836853  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4377  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.54 
 
 		 565 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0111987  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4691  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.54 
 
 		 565 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4605  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.54 
 
 		 565 aa  64.3  0.0000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0011627  normal  0.838171 
 
 
-
 
CP001509  ECD_04006  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.54 
 
 		 565 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03968  hypothetical protein  32.54 
 
 		 565 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3876  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.54 
 
 		 565 aa  63.9  0.0000000008  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3410  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.15 
 
 		 570 aa  63.5  0.000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5652  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.54 
 
 		 565 aa  63.5  0.000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000390549  normal  0.76636 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0606  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.74 
 
 		 590 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653759 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2790  thiol:disulfide interchange protein DsbD  35.97 
 
 		 589 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2329  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30.72 
 
 		 606 aa  63.2  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0733929  normal  0.104839 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03921  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.91 
 
 		 631 aa  62.4  0.000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0716  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.23 
 
 		 595 aa  62  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0403  thiol:disulfide interchange protein precursor  30.77 
 
 		 561 aa  62.4  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.471471  hitchhiker  0.00764608 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4604  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.86 
 
 		 593 aa  62  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.138187 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0546  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 613 aa  61.6  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0488882  normal  0.137935 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3576  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 613 aa  62  0.000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.784092 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0372  Protein-disulfide reductase  35.59 
 
 		 750 aa  62  0.000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.754802  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3856  Protein-disulfide reductase  31.75 
 
 		 565 aa  61.6  0.000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4593  thiol:disulfide interchange protein precursor  33.33 
 
 		 567 aa  61.2  0.000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.610696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0583  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.65 
 
 		 610 aa  61.6  0.000000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0663  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.38 
 
 		 619 aa  61.6  0.000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4741  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.5 
 
 		 567 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3915  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  35.45 
 
 		 613 aa  61.2  0.000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3630  C-type cytochrome biogenesis protein (copper tolerance)  38.19 
 
 		 794 aa  60.8  0.000000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.302281  normal  0.687472 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0600  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.86 
 
 		 590 aa  61.2  0.000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4601  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.5 
 
 		 567 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.506654  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4719  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.5 
 
 		 567 aa  61.2  0.000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0129572  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4858  thiol:disulfide interchange protein DsbD  34.23 
 
 		 604 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4398  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.23 
 
 		 606 aa  60.8  0.000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.898445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2980  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  30 
 
 		 611 aa  60.8  0.000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.702235  normal  0.0981242 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0561  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.86 
 
 		 590 aa  60.8  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0636  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.19 
 
 		 619 aa  60.8  0.000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0696  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.48 
 
 		 610 aa  60.5  0.000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3406  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.48 
 
 		 613 aa  60.5  0.000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0237355 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0659  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.19 
 
 		 619 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3726  thiol:disulfide interchange protein precursor  34.19 
 
 		 619 aa  60.5  0.000000009  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53604  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4684  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.5 
 
 		 567 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0446  protein-disulfide reductase  28.35 
 
 		 731 aa  60.1  0.00000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0285  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  33.61 
 
 		 789 aa  60.5  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.352123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4244  protein-disulfide reductase  37.37 
 
 		 600 aa  60.5  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.438007 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3266  thiol:disulfide interchange protein precursor  31.62 
 
 		 602 aa  59.7  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00603996 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0323  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.74 
 
 		 563 aa  60.5  0.00000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000046864 
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4193  putative thiol:disulfide interchange transmembrane protein  31.25 
 
 		 151 aa  59.3  0.00000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00678972 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3247  thiol:disulfide interchange protein precursor  36.75 
 
 		 604 aa  59.3  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00156  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.46 
 
 		 592 aa  59.3  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0028  protein-disulfide reductase  32.76 
 
 		 623 aa  58.9  0.00000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2559  thiol:disulfide interchange protein DsbD  33.63 
 
 		 752 aa  58.2  0.00000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.745294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0084  thiol:disulfide interchange protein precursor  32.08 
 
 		 592 aa  57.8  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4907  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  35.61 
 
 		 602 aa  56.6  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.955907 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3247  cytochrome c biogenesis protein transmembrane region  32.5 
 
 		 616 aa  57  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0836496  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>