27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_1964 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_1964  putative lipoprotein  100 
 
 
247 aa  473  1e-132  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0700691  hitchhiker  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2076  putative lipoprotein  44.36 
 
 
276 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128092  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6128  putative lipoprotein  45.53 
 
 
305 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2411  hypothetical protein  44.67 
 
 
246 aa  145  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2330  putative lipoprotein  42.79 
 
 
244 aa  137  2e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0461141  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3752  putative lipoprotein  48.1 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1194  putative lipoprotein  44.05 
 
 
280 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1101  putative lipoprotein  44.05 
 
 
280 aa  133  3e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1273  putative lipoprotein  43.61 
 
 
282 aa  131  7.999999999999999e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.958512 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3486  putative lipoprotein  42.4 
 
 
271 aa  125  5e-28  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1144  putative lipoprotein  43.75 
 
 
258 aa  119  3.9999999999999996e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0160  putative lipoprotein  44.72 
 
 
251 aa  113  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4640  putative lipoprotein  38.87 
 
 
277 aa  104  1e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2178  hypothetical protein  31.95 
 
 
246 aa  66.6  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0131  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.52 
 
 
227 aa  62.8  0.000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1051  2-phosphosulfolactate phosphatase  22.13 
 
 
241 aa  62.4  0.000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00427368  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0129  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.52 
 
 
227 aa  62.4  0.000000007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.774772  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0407  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.15 
 
 
239 aa  55.1  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.932789  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4415  2-phosphosulfolactate phosphatase  29.41 
 
 
236 aa  50.8  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587802  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1552  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.48 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2338  2-phosphosulfolactate phosphatase  33.04 
 
 
254 aa  47.4  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0044  2-phosphosulfolactate phosphatase  22.17 
 
 
233 aa  46.2  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.447715  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2823  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.58 
 
 
234 aa  46.2  0.0005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1806  2-phosphosulfolactate phosphatase  29.52 
 
 
260 aa  44.7  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0247  hypothetical protein  52 
 
 
241 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2881  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.66 
 
 
247 aa  43.5  0.003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2562  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.67 
 
 
247 aa  42  0.009  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>