35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_1101 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_1101  putative lipoprotein  100 
 
 		 280 aa  569  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1194  putative lipoprotein  98.93 
 
 		 280 aa  563  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1273  putative lipoprotein  86.52 
 
 		 282 aa  482  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.958512 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2330  putative lipoprotein  47.33 
 
 		 244 aa  183  3e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0461141  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2411  hypothetical protein  46.09 
 
 		 246 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3752  putative lipoprotein  46.5 
 
 		 250 aa  169  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2076  putative lipoprotein  43.97 
 
 		 276 aa  162  6e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128092  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3486  putative lipoprotein  43.43 
 
 		 271 aa  160  1e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6128  putative lipoprotein  42.68 
 
 		 305 aa  156  4e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1964  putative lipoprotein  44.05 
 
 		 247 aa  133  3.9999999999999996e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0700691  hitchhiker  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0160  putative lipoprotein  46.28 
 
 		 251 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1144  putative lipoprotein  40.55 
 
 		 258 aa  124  2e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4640  putative lipoprotein  43.37 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2178  hypothetical protein  34.14 
 
 		 246 aa  70.1  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1552  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.35 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0129  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.66 
 
 		 227 aa  55.8  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.774772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0131  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.78 
 
 		 227 aa  55.5  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0750  2-phosphosulfolactate phosphatase  31.44 
 
 		 282 aa  54.7  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.158423  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1051  2-phosphosulfolactate phosphatase  24.02 
 
 		 241 aa  52  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00427368  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06701  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.12 
 
 		 249 aa  50.8  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.284053  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1570  2-phosphosulfolactate phosphatase  33.11 
 
 		 240 aa  50.8  0.00003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1805  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.55 
 
 		 249 aa  50.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.191126  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0247  hypothetical protein  46.81 
 
 		 241 aa  49.7  0.00005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4549  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.66 
 
 		 236 aa  49.7  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.587181 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0614  2-phosphosulfolactate phosphatase  28.33 
 
 		 222 aa  49.7  0.00006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0407  2-phosphosulfolactate phosphatase  24.22 
 
 		 239 aa  49.3  0.00007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.932789  normal  0.264008 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2138  2-phosphosulfolactate phosphatase  27.69 
 
 		 267 aa  48.9  0.00008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.506693  normal  0.243415 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21780  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.87 
 
 		 242 aa  47  0.0004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1161  2-phosphosulfolactate phosphatase  21.49 
 
 		 248 aa  46.2  0.0005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.862609  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0819  2-phosphosulfolactate phosphatase  28.09 
 
 		 244 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.068117 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4415  2-phosphosulfolactate phosphatase  24.43 
 
 		 236 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587802  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2823  2-phosphosulfolactate phosphatase  23.45 
 
 		 234 aa  45.1  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0497  2-phosphosulfolactate phosphatase  28.45 
 
 		 245 aa  45.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.418172 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1002  2-phosphosulfolactate phosphatase  18.33 
 
 		 257 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1166  2-phosphosulfolactate phosphatase  20 
 
 		 248 aa  43.5  0.004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>