18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_1144 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_1144  putative lipoprotein  100 
 
 		 258 aa  479  1e-134  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2076  putative lipoprotein  44.06 
 
 		 276 aa  141  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.128092  normal  0.436736 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1194  putative lipoprotein  41.34 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1101  putative lipoprotein  41.34 
 
 		 280 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6128  putative lipoprotein  41.58 
 
 		 305 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413679  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1273  putative lipoprotein  41.86 
 
 		 282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.958512 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1964  putative lipoprotein  44.14 
 
 		 247 aa  129  4.0000000000000003e-29  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0700691  hitchhiker  0.0000413704 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2411  hypothetical protein  39.46 
 
 		 246 aa  124  2e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2330  putative lipoprotein  34.22 
 
 		 244 aa  122  5e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0461141  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3486  putative lipoprotein  37.16 
 
 		 271 aa  107  2e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0160  putative lipoprotein  43.51 
 
 		 251 aa  97.4  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000155251 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3752  putative lipoprotein  37.8 
 
 		 250 aa  97.8  2e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4640  putative lipoprotein  37.22 
 
 		 277 aa  86.7  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1552  2-phosphosulfolactate phosphatase  25.21 
 
 		 231 aa  49.3  0.00005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2178  hypothetical protein  30.97 
 
 		 246 aa  47  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0247  hypothetical protein  44.23 
 
 		 241 aa  44.3  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0129  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.89 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.774772  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0131  2-phosphosulfolactate phosphatase  26.89 
 
 		 227 aa  42.7  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>